PRJNA1413303:人源多物种微生物组(主要来自粪便,也含皮肤、口腔、鼻腔和生殖道部位)宏基因组

该数据集包含来自报告系统性体臭、PATM(People Are Allergic to Me)及特发性体臭(包括代谢性体臭 MEBO)参与者的粪便样本 16S rRNA 基因扩增子测序数据,属于一项虚拟开展的临床试验(ClinicalTrials.gov 标识 NCT03582826)

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基因组分类Metagenome
PRJNA1413303: Human-associated multispecies microbiomes mostly from stool, but also skin, oral, nasal, and genital sites Metagenome

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1413303:人源多物种微生物组(主要来自粪便,也含皮肤、口腔、鼻腔和生殖道部位)宏基因组

该数据集包含来自报告系统性体臭、PATM(People Are Allergic to Me)及特发性体臭(包括代谢性体臭 MEBO)参与者的粪便样本 16S rRNA 基因扩增子测序数据,属于一项虚拟开展的临床试验(ClinicalTrials.gov 标识 NCT03582826)。研究旨在探究肠道微生物组成,识别与体臭相关表型及代谢性气味障碍(包括 trimethylaminuria,TMAU)相关的微生物分类群。部分志愿者接受了 TMAU 临床检测,识别出原发性(遗传性)TMAU 和与肠道微生物失调相关的继发性(非遗传性)TMAU。数据支持 Gabashvili IS, JMIR Dermatology 2020;3(1):。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含来自报告系统性体臭、People Are Allergic to Me (PATM) 和特发性体臭状况(包括代谢性体臭 (MEBO))参与者的粪便样本的 16S rRNA 基因扩增子测序,作为一项虚拟开展的临床试验(ClinicalTrials.gov 标识符:NCT03582826)的一部分收集。该研究旨在调查肠道微生物组成,并识别与体臭相关表型和代谢性气味障碍(包括 trimethylaminuria (TMAU))相关的微生物分类群。在研究志愿者中,一部分人接受了 TMAU 临床检测,识别出原发性(遗传性)TMAU 和与肠道微生物失调相关的继发性(非遗传性)TMAU。这些数据支持 Gabashvili IS, JMIR Dermatology 2020;3(1):e10508 中报告的发现。提供原始序列数据以支持透明度、可重复性和二次

【主题与分类】

主题标签:Metagenome。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1413303

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1413303

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  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自报告全身性异味、人们对我不耐受(PATM)及特发性异味状况(包括代谢性体味,MEBO)参与者的粪便样本的16S rRNA基因扩增子测序,这些样本作为一项虚拟进行的临床试验(ClinicalTrials.gov标识符:NCT03582826)的一部分被收集。该研究旨在探究肠道微生物组成,并识别与异味相关表型及代谢性气味障碍(包括三甲胺尿症,TMAU)相关的微生物分类群。在研究志愿者中,一部分人接受了TMAU的临床检测,发现了与肠道微生物失调相关的原发性(遗传性)TMAU和继发性(非遗传性)TMAU。这些数据支持了Gabashvili IS在《JMIR Dermatology》2020;3(1):e10508中报告的研究结果。提供原始序列数据旨在支持透明度、可重复性以及对微生物组-异味关联的二次分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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