基本信息

模态

基因组

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

超重成人随机对照试验基线唾液16S rRNA基因测序数据

该数据集为一项随机对照试验的基线唾液16S rRNA基因测序数据，研究对象为超重成人。数据来自NCBI BioProject，编号PRJEB108444，源站标题涉及绿茶与红茶康普茶消费的影响。BioProject是围绕单一研究计划汇集生物数据的记录，来源于单一机构或联合体，为用户提供查找该项目所产生多种数据类型链接的统一入口。该数据集在本站归类于内分泌、营养和代谢疾病下的其他类别，主题标签为Other，来源站为ncbi.nlm.nih.gov。整体而言，该数据可用于了解超重人群在干预前的唾液微生物组成基线情况，为后续分析绿茶与红茶康普茶消费对口腔微生物群的影响提供对照基础。

【数据集背景】

该数据集所属研究为一项随机对照试验，关注绿茶与红茶康普茶消费的影响。研究对象为超重成人。源站标题明确指向“绿茶与红茶康普茶消费”的效果，而本数据集特指该试验的基线唾液16S rRNA基因测序数据。NCBI BioProject作为生物数据汇集平台，为该项目提供统一的数据查找入口，便于研究者定位与该项目相关的多种数据类型。本站将其归入内分泌、营养和代谢疾病类别下的其他分类，主题标签为Other。

【数据内容】

该数据集为唾液16S rRNA基因测序数据，属于基线阶段，即干预或随访开始前的样本检测结果。研究对象为超重成人。16S rRNA基因测序通常用于分析样本中的细菌群落组成，因此该数据可用于刻画超重成人唾液微生物群的基线特征。源站未提供具体的样本数量、测序平台、序列读长、操作分类单元数量、微生物多样性指标或任何统计结果。

【采集与来源】

数据来源站为ncbi.nlm.nih.gov，属于NCBI BioProject数据库，项目编号为PRJEB108444。源站描述指出，BioProject记录汇集了与单一研究计划相关的生物数据，这些数据可能来自单一机构或联合体，并为用户提供查找该项目所产生多种数据类型的统一入口。源站未提供样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、纳入排除标准或受试者人口学细节。

【适用场景】

该数据集可用于超重成人口腔微生物群基线特征的研究，也可作为随机对照试验中干预前对照数据，用于后续比较绿茶与红茶康普茶消费对唾液微生物组成的影响。此外，该数据可服务于口腔微生物生态学、营养与代谢相关微生物组研究等场景。源站未提供该数据在其他特定分析场景下的适用性说明。

【使用方法】

源站未提供具体的数据下载方式、文件格式、分析流程或软件工具建议。用户可通过NCBI BioProject编号PRJEB108444在ncbi.nlm.nih.gov上查找该项目及其关联数据。源站未提供数据处理、质量控制或统计分析的具体步骤。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估信息，包括测序深度、序列质量、污染控制、重复性检验等。源站未提供该数据集的局限性说明，例如样本代表性、基线数据无法推断因果关系等。该数据集仅为基线数据，不包含干预后的随访结果，因此不能单独用于评估绿茶与红茶康普茶消费的效果。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、许可协议或使用限制。用户应参考NCBI BioProject页面及相关数据记录获取引用与许可信息。源站未提供具体的文献引用或数据使用条款。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJEB108444

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB108444

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究包含从一项随机对照试验中招募的超重成人唾液样本获得的16S rRNA基因扩增子测序数据，该试验旨在探究在健康限能量饮食条件下绿茶康普茶对代谢及微生物群相关参数的影响。本数据集对应于一项二次横断面分析所用的基线样本，该分析探讨了唾液微生物群组成的性别特异性差异及其与代谢健康标志物的关联。唾液样本按照标准化程序采集，并通过16S rRNA基因V4区域的PCR扩增和Illumina平台双端测序进行细菌群落谱分析。数据中不包含人类基因组序列。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别