PBC患者表型组数据集
该数据集来自 omicsdi.org，英文名为 Phenome of PBC patients，主题标签为 Genomics，本站归类于内分泌、营养和代谢疾病下的其他类
基本信息
资源简介
PBC患者表型组数据集
Phenome of PBC patients 是一个以原发性胆汁性胆管炎患者为对象的表型组数据集，英文名称即 Phenome of PBC patients，主题标签为 Genomics，在来源站点 omicsdi.org 上登记，本站将其归入内分泌、营养和代谢疾病分类下的其他类。从来源站给出的描述看，该数据集关注的是与原发性胆汁性胆管炎患者对熊去氧胆酸治疗应答不足相关的代谢表型和细菌表型，因此其内容指向患者在接受熊去氧胆酸治疗后的应答差异，以及与之相伴的代谢特征和细菌特征。整体而言，该数据集属于组学数据资源，围绕原发性胆汁性胆管炎这一疾病场景，将治疗应答这一临床问题与代谢、微生物相关表型联系起来，为相关研究提供可检索、可发现的数据入口。
【数据集背景】
原发性胆汁性胆管炎是一种以胆管受累为特征的疾病，熊去氧胆酸是与之相关的治疗药物。来源站描述明确指出，该数据集所涉及的表型与原发性胆汁性胆管炎患者对熊去氧胆酸治疗应答不足相关。也就是说，数据集的问题背景落在治疗应答这一环节：部分患者对熊去氧胆酸治疗的反应不充分，而代谢表型和细菌表型可能与这种应答不足存在关联。数据集以“Phenome of PBC patients”为名，表明其观察层面是患者的表型组，而非单一指标。主题标签为 Genomics，说明该资源在组学维度上被归入基因组学相关范畴。本站将其归入内分泌、营养和代谢疾病下的其他类，反映了该数据集在疾病分类体系中的位置。上述背景信息均来自来源站描述与分类信息，更具体的疾病机制、人群构成和研究设计源站未提供。
【数据内容】
依据来源站描述，该数据集的内容围绕与熊去氧胆酸治疗应答不足相关的代谢表型和细菌表型展开，涉及原发性胆汁性胆管炎患者。主题标签为 Genomics，表明其在组学数据类型上属于基因组学相关资源。数据集的英文名称为 Phenome of PBC patients，指向患者表型组的整体刻画。除上述内容外，数据的具体构成，例如包含哪些样本、覆盖哪些代谢物或细菌类群、采用何种检测平台、数据文件的格式与规模等，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org，并在本站登记展示。来源站描述给出了该数据集的研究主题，即与原发性胆汁性胆管炎患者熊去氧胆酸治疗应答不足相关的代谢和细菌表型。关于样本采集地点、采集时间、纳入与排除标准、伦理审批信息以及原始数据产生机构等，源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息，该数据集可用于围绕原发性胆汁性胆管炎治疗应答的组学数据检索与发现，适合关注熊去氧胆酸应答不足相关代谢表型和细菌表型的研究者作为数据资源入口进行查找。其 Genomics 主题标签也使其可被纳入组学相关的数据整合与索引场景。关于该数据集在具体分析任务中的适用性，例如是否适合作为某类模型的训练数据或验证数据，源站未提供。
【使用方法】
该数据集通过 omicsdi.org 发布并可被检索发现，本站亦提供其分类与主题标签信息以辅助定位。关于数据下载方式、访问权限、文件组织结构和配套分析工具等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的主题与来源站描述明确，分类与标签信息完整。但关于数据质量评价、样本量、数据完整性、批次效应控制以及结果可重复性等信息，源站未提供。使用者应注意，现有信息仅能支持对该数据集主题范围的认识，不足以判断其具体数据质量水平。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议和使用条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/project/PRJEB44791
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Metabolic and bacterial phenotypes associated with inadequate ursodeoxycholic acid treatment response in patients with primary biliary cholangitis
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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