NCBI BioSystems 数据库
此次退役包括 BioSystems 记录在 NCBI Entrez 系统中的呈现以及 BioSystems 内容的查看器

基本信息
资源简介
NCBI BioSystems 数据库
NCBI BioSystems Database 是一个以生物系统相关记录为对象的数据库资源,其英文名称为 NCBI BioSystems Database。本站将其归入“内分泌、营养和代谢疾病 / 其他”分类。该数据集的相关信息来源于 web.archive.org 的存档页面。根据源站描述,该数据库所涉及的一项退役安排包括 BioSystems 记录在 NCBI Entrez 系统中的呈现,以及 BioSystems 内容的查看器;NCBI 目前通过定期更新的 PubChem Pathways 资源提供代谢通路及其他生物系统数据,该资源提供新颖、扩展且更现代的界面。以下依据现有信息对该数据集作进一步说明。
【数据集背景】
NCBI BioSystems Database 是 NCBI 体系下与生物系统记录相关的数据库资源。从源站描述可知,该资源经历了一次退役过程,此次退役的范围明确包括两个方面:一是 BioSystems 记录在 NCBI Entrez 系统中的呈现,二是 BioSystems 内容的查看器。这意味着原先通过 Entrez 系统呈现 BioSystems 记录的方式以及相应的内容查看器均属于退役安排所涵盖的内容。与此同时,NCBI 将代谢通路及其他生物系统数据的提供渠道转向 PubChem Pathways 资源,该资源被描述为定期更新,并具有新颖、扩展和更现代的界面。上述背景构成了理解该数据集当前状态的基本前提。
【数据内容】
该数据集的内容围绕 BioSystems 记录展开。源站描述提及 BioSystems 记录在 NCBI Entrez 系统中的呈现,以及 BioSystems 内容的查看器,说明 BioSystems 记录及其内容查看构成该资源的核心组成部分。此外,源站描述还提及代谢通路及其他生物系统数据,这些数据现由 PubChem Pathways 资源提供。关于 BioSystems 记录的具体字段构成、记录数量、覆盖物种范围、通路条目明细等内容层面的细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的信息来源站为 web.archive.org,即通过存档页面获取相关描述。源站描述本身说明了 NCBI 对 BioSystems 相关呈现方式与查看器的退役安排,以及转向 PubChem Pathways 资源提供代谢通路和其他生物系统数据的现状。关于原始数据的采集方法、更新频率、数据提交与审核流程等,源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息,该数据集及其相关记录可用于了解 NCBI BioSystems 记录的呈现方式与内容查看方式,以及理解该资源退役后代谢通路和其他生物系统数据转向 PubChem Pathways 资源提供的背景。本站将其归入“内分泌、营养和代谢疾病 / 其他”分类,提示其在该分类语境下具有参考意义。关于具体的科研分析、临床决策或教学应用场景,源站未提供。
【使用方法】
源站描述指出,BioSystems 记录原先在 NCBI Entrez 系统中呈现,并配有 BioSystems 内容的查看器;此次退役涵盖这两部分。NCBI 目前通过定期更新的 PubChem Pathways 资源提供代谢通路及其他生物系统数据,该资源具有新颖、扩展且更现代的界面。因此,获取相关数据的途径指向 PubChem Pathways 资源。关于具体的访问步骤、接口调用方式、查询语法或数据下载格式等操作细节,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集当前处于相关呈现方式与查看器已退役的状态,这是使用该资源时需要重点考虑的限制。源站描述将 PubChem Pathways 资源描述为定期更新、新颖、扩展且更现代,这构成对替代资源特性的说明。关于 BioSystems 记录本身的准确性、完整性、一致性、更新时效以及存档页面的完整性等质量指标,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用格式、许可条款与使用限制,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://web.archive.org/web/20220403144802/https:/www.ncbi.nlm.nih.gov/biosystems
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
<< >>!!!>>> 此次退役包括BioSystems记录在NCBI Entrez系统中的展示以及BioSystems内容的查看器。NCBI现在通过定期更新的PubChem Pathways资源(https://pubchemdocs.ncbi.nlm.nih.gov/pathways)提供代谢途径和其他生物系统数据,该资源提供了一个新颖、扩展且更现代的界面。
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