严重烧伤后微生物组变化的临床与免疫学效应监测

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT07329595

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：严重烧伤患者、肠道微生物群多样性与组成、炎症反应。严重烧伤可引起应激相关的肠道损伤，导致肠道灌注减少、细胞损伤、黏膜通透性增加及肠道蠕动减弱。这些病理生理变化促进细菌和内毒素易位，使肠道微生物群成为内源性感染的主要来源。近期证据表明，肠道微生物群在调节免疫反应和支持伤后恢复中发挥关键作用，同时也参与脓毒症和多器官衰竭等并发症的发生。本研究旨在利用粪便样本纵向监测严重烧伤后肠道微生物群的动态变化。在标准营养方案和重症监护管理下，进行连续粪便采样，以评估微生物群多样性和组成的变化，以及这些变化对可测量的炎症生物标志物、内分泌、血液学、免疫学及其他器官特异性参数、临床病程和患者结局的间接影响。

临床结局依据死亡率、住院时间、机械通气持续时间、继发感染发生率、菌血症发生率、器官衰竭及其严重程度（采用SOFA评分评估）以及伤口愈合情况进行评估。入组时，患者接受直肠拭子采集和初始粪便采样，随后每周采集粪便样本1至2次，同时除标准治疗外每周进行实验室检查。对于微生物组分析，从粪便样本中提取DNA，随后对16S细菌rRNA操纵子进行PCR扩增。对扩增区域进行测序，并根据序列数据鉴定分类群。计算分类群的相对丰度，并比较单个患者系列样本内及患者之间的α多样性和β多样性指标。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。