健康与疾病状态下人类口腔微生物组的宏转录组
该数据集来自 search.dataone.org，聚焦健康与疾病状态下人类口腔微生物组的宏转录组。研究利用患者配对的健康与患病牙周样本，比较16万个基因的表达，发现健康与患病群落在代谢上存在患者间保守的差异，而单个物种的代谢基因表达高度可变
基本信息
资源简介
健康与疾病状态下人类口腔微生物组的宏转录组
Metatranscriptomics of the human oral microbiome during health and disease
该数据集来自 search.dataone.org，聚焦健康与疾病状态下人类口腔微生物组的宏转录组。研究利用患者配对的健康与患病牙周样本，比较16万个基因的表达，发现健康与患病群落在代谢上存在患者间保守的差异，而单个物种的代谢基因表达高度可变。数据可用于口腔微生物组功能研究、牙周炎相关代谢变化分析及宏转录组方法学参考（来源 DataONE，CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：人类微生物组在健康中发挥重要作用，但当其被破坏时，这些同样的本土微生物可导致疾病。微生物组的组成在从健康向疾病转变期间发生变化；然而，这些变化在患者之间往往并不保守。由于牙周炎等微生物组相关疾病尽管患者间微生物群落组成存在变异性，却引起相似的患者症状，我们假设人类相关微生物群落在疾病期间经历保守的代谢变化。在此，我们使用患者配对的健康与患病样本，比较健康与患病牙周群落中16万个基因的基因表达。我们表明，健康与患病群落表现出患者间保守的明确代谢差异。相比之下，单个物种的代谢基因表达高度可变。
【主题与分类】
主题标签：periodontitis、metatranscriptomics、RNA-seq、metagenomics、infectious disease。本站分类：内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://search.dataone.org/view/sha256%3A0ab742568c574d4f87f706b2cd8eb3c56949312e290c0f1e312d4ed92b28fbed
使用许可：CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
人类微生物组在健康中发挥着重要作用，但当其受到破坏时，这些原本共生的微生物也可引发疾病。在从健康向疾病转变的过程中，微生物组的组成会发生变化；然而，这些变化在患者之间往往并不保守。由于诸如牙周炎等微生物组相关疾病尽管在患者间微生物群落组成存在差异，却会引起相似的患者症状，我们假设人类相关微生物群落在疾病过程中会发生保守的代谢变化。在此，我们利用患者匹配的健康与疾病样本，比较了健康和患病牙周群落中16万个基因的基因表达。我们发现，健康和患病群落在代谢方面表现出明确的差异，且这些差异在患者之间是保守的。相比之下，单个物种的代谢基因表达在患者之间高度可变。这些结果表明，尽管患者间微生物组成存在高度差异，患病群落仍表现出保守的代谢谱，而这些代谢谱通常由患者特异性的微生物类群来实现。
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