脊索瘤免疫浸润与转录状态及代谢谱的关联
该数据集来自 omicsdi.org，聚焦脊索瘤的免疫浸润与转录状态及代谢谱关联研究。数据涵盖 13 位脊索瘤患者的 16 个样本，采用 NEDC 作为基质进行全切片空间代谢组学和脂质组学分析，在 20 µm 空间分辨率下使用 rapifleX MALDI-TOF/TOF 系统采集，负离子反射模式，
基本信息
资源简介
脊索瘤免疫浸润与转录状态及代谢谱的关联
该数据集聚焦脊索瘤中免疫浸润与转录状态及代谢谱之间的关联，来源于 omicsdi.org，主题标签为蛋白质组学，本站分类归入内分泌、营养和代谢疾病下的其他类别。数据集包含来自 13 位脊索瘤患者的 16 个样本，采用 NEDC 作为基质进行全切片空间代谢组学和脂质组学分析，在 20 µm 空间分辨率下使用 rapifleX MALDI-TOF/TOF 系统采集，负离子反射模式，质量检测范围为 60 至 1200 m/z，每个像素以 10 kHz 激光重复频率采集 50 次。该数据集可用于探索脊索瘤组织中免疫浸润、转录状态与代谢特征之间的空间关联。
【数据集背景】
脊索瘤是一种较为罕见的肿瘤，其分子特征和代谢特征之间的关系是研究关注点之一。该数据集围绕免疫浸润与不同转录状态及代谢谱之间的关联展开，旨在通过空间代谢组学和脂质组学手段，为理解脊索瘤的免疫微环境与代谢异质性提供数据基础。数据集主题标签为蛋白质组学，本站分类为内分泌、营养和代谢疾病 / 其他。
【数据内容】
该数据集包含来自 13 位脊索瘤患者的 16 个样本。数据为全切片空间代谢组学和脂质组学数据，采用 NEDC 作为基质。采集过程中使用 rapifleX MALDI-TOF/TOF 系统，在负离子反射模式下运行，空间分辨率为 20 µm，质量检测范围为 60 至 1200 m/z。每个像素以 50 次激光 shots 采集，激光重复频率为 10 kHz。关于实验设计和分析的更多细节，需参考与该数据集相关的出版物。
【采集与来源】
数据来源于 omicsdi.org。样本为脊索瘤患者组织切片，共 13 位患者的 16 个样本。采集平台为 rapifleX MALDI-TOF/TOF 系统（Bruker Daltonics），采用负离子反射模式，空间分辨率 20 µm，质量范围 60 至 1200 m/z，每个像素 50 shots，激光重复频率 10 kHz。基质为 NEDC。源站未提供更具体的采集地点、时间或机构信息。
【适用场景】
该数据集适用于脊索瘤空间代谢组学与脂质组学分析，可用于研究免疫浸润与转录状态及代谢谱之间的关联。由于采用全切片空间成像方式，可用于探索组织内代谢物和脂质的空间分布特征。主题标签为蛋白质组学，也可为相关组学整合分析提供参考。源站未提供其他具体适用场景。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明。关于实验设计和分析的更多细节，需参考与该数据集相关的出版物。用户可根据源站描述中提供的采集参数和样本信息，结合相关出版物进行数据解读和再分析。
【质量与限制】
源站未提供质量评估信息。数据集样本量有限，包含 13 位脊索瘤患者的 16 个样本。采集参数明确，包括空间分辨率 20 µm、质量范围 60 至 1200 m/z、负离子反射模式、每个像素 50 shots、激光重复频率 10 kHz。源站未提供其他质量与限制说明。
【引用与许可】
源站未提供引用与许可信息。关于实验设计和分析的更多细节，需参考与该数据集相关的出版物。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000100742
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
来自13例脊索瘤患者的16份样本的空间代谢组学和脂质组学。使用NEDC作为基质对整个玻片进行成像分析。数据采集使用rapifleX MALDI-TOF/TOF系统（Bruker Daltonics），在反射模式下以负极性运行，空间分辨率为20 µm，检测质荷比范围为60至1200 m/z。每个像素以10 kHz的激光重复频率采集50次激光发射。有关实验设计和分析的更多详细信息，请参阅与该数据集相关的出版物。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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