HCV血浆GC-MS代谢组学峰面积数据集:30例HCV样本与30例健康对照

该数据集包含来自60名匿名研究参与者的血浆气相色谱-质谱(GC-MS)代谢组学峰面积数据,其中包括30例HCV感染样本和30例健康对照样本

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时间序列分类HCVGC-MS血浆代谢组学代谢谱分析病毒性肝炎
HCV Plasma GC-MS Metabolomics Peak-Area Dataset: 30 HCV Samples and 30 Healthy Controls

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

HCV血浆GC-MS代谢组学峰面积数据集:30例HCV样本与30例健康对照

该数据集为血浆气相色谱-质谱(GC-MS)代谢组学峰面积数据,来源于一项纳入60名匿名研究参与者的研究,其中30例为HCV感染样本,30例为健康对照样本。数据涵盖21个代谢物特征的峰面积测量值,并包含分析过程中作为内标使用的十七烷酸的峰面积测量值。样本标识为匿名研究编号,不含直接个人身份信息。数据集中的数值代表GC-MS峰面积信号,不应被解读为代谢物的绝对浓度;数据未提供浓度校准或使用真实标准品进行的定量验证,代谢物注释为推定性的、基于谱库的注释,未经真实分析标准品独立确认。该数据集发布于Zenodo,采用知识共享署名4.0国际许可,主题涉及丙型肝炎病毒、HCV感染、病毒性肝炎、血浆代谢组学、气相色谱-质谱联用及代谢谱分析等方向。

【数据集背景】

该数据集面向丙型肝炎病毒(HCV)感染相关的血浆代谢组学研究。HCV感染属于病毒性肝炎范畴,在本站分类中归入内分泌、营养和代谢疾病下的“其他”类别。数据集通过气相色谱-质谱(GC-MS)平台获取血浆代谢组学峰面积信号,旨在为HCV感染与健康状态之间的代谢特征比较提供基础数据。数据集包含30例HCV感染样本和30例健康对照样本,合计60名匿名研究参与者,构成病例与对照相匹配的研究设计。相关主题标签涵盖Hepatitis C virus、HCV、Plasma metabolomics、Metabolomics、Gas chromatography-mass spectrometry、Metabolic profiling、HCV infection、Viral hepatitis及Metabolomics dataset等,便于在代谢组学与病毒性肝炎相关检索场景中被发现和复用。

【数据内容】

数据集的核心内容为血浆GC-MS代谢组学峰面积数据。具体而言,数据包含60名匿名研究参与者的样本,其中30例为HCV感染样本、30例为健康对照样本;每个样本包含21个代谢物特征的峰面积测量值,此外还包含十七烷酸(heptadecanoic acid)的峰面积测量值,该物质在分析过程中作为内标使用。样本标识采用匿名研究编号,不包含直接个人身份信息。需要强调的是,数据集中的数值为GC-MS峰面积信号,并非绝对代谢物浓度;数据未附带浓度校准信息,也未提供使用真实标准品开展的定量验证。代谢物注释为推定性的、基于谱库的注释,未使用真实分析标准品进行独立确认。

【采集与来源】

该数据集来源于doi.org,发布机构为Zenodo,发布时间为2026年。数据由Sridevi Mardham、Anju Verma、Usha Kalawat、Ramakrishna Nukaboina、Aparna Jangam、Narendra Hulikal、Sravani Kaveti共同完成。样本来自60名匿名研究参与者,分为HCV感染组(30例)与健康对照组(30例)。分析平台为气相色谱-质谱(GC-MS),检测对象为血浆样本,输出结果为峰面积信号。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息及具体GC-MS仪器参数,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于血浆代谢组学的探索性分析与方法学研究,例如HCV感染组与健康对照组之间峰面积信号的比较分析、代谢特征筛选的初步探索、GC-MS代谢组学数据处理流程的测试与演示,以及代谢组学教学与算法验证等场景。由于数据以峰面积信号形式提供且注释为推定性注释,其更适合用于相对信号层面的模式发现与假设生成,而不适合直接用于绝对定量分析或临床诊断结论的推导。主题标签所覆盖的HCV感染、病毒性肝炎与代谢谱分析等方向,也可作为相关研究检索与数据复用的参考。

【使用方法】

使用该数据集时,应将各代谢物特征的峰面积视为相对信号而非绝对浓度,并可结合十七烷酸内标的峰面积信息对信号进行参照性处理。由于样本标识为匿名研究编号,分析时可依据HCV感染与健康对照的分组信息进行组间比较。鉴于代谢物注释为基于谱库的推定性注释,在解释具体代谢物身份时应保持谨慎,必要时应结合真实标准品进行独立确认。数据未提供浓度校准或定量验证信息,因此不宜将峰面积直接换算为浓度值。关于具体的数据文件格式、字段结构及配套元数据说明,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的主要限制包括:数据值为GC-MS峰面积信号,不能解释为绝对代谢物浓度;未提供浓度校准或使用真实标准品的定量验证;代谢物注释为推定性的、基于谱库的注释,未经真实分析标准品独立确认。此外,数据集仅包含60名参与者(30例HCV感染样本与30例健康对照样本)及21个代谢物特征的峰面积,样本量与特征规模有限。样本标识虽为匿名研究编号且不含直接个人身份信息,但关于伦理审批、样本采集与处理细节、仪器参数及质量控制流程等信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集采用知识共享署名4.0国际(Creative Commons Attribution 4.0 International)许可,使用时需按照许可要求进行署名。数据发布机构为Zenodo,发布时间为2026年,来源站为doi.org。引用时应注明数据集英文名称“HCV Plasma GC-MS Metabolomics Peak-Area Dataset: 30 HCV Samples and 30 Healthy Controls”及作者Sridevi Mardham、Anju Verma、Usha Kalawat、Ramakrishna Nukaboina、Aparna Jangam、Narendra Hulikal、Sravani Kaveti。关于具体引用格式、DOI编号及版本信息,源站未提供。

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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.22804924

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集包含来自60名匿名研究参与者的血浆气相色谱-质谱(GC-MS)代谢组学峰面积数据,其中包括30份HCV感染样本和30份健康对照样本。数据集包含21种代谢物特征的峰面积测量值,以及十七烷酸的峰面积测量值,后者在分析过程中用作内标。样本标识符为匿名研究ID,不包含任何直接的个人身份信息。本数据集提供的数值代表GC-MS峰面积信号,不应被解释为绝对代谢物浓度。本数据集未提供使用真实标准品进行的浓度校准或定量验证。代谢物注释为推定/基于数据库的注释,未经真实分析标准品独立确认。所 depositing 的峰面积值未进行内标归一化处理。因此,本数据集代表的是记录的GC-MS峰面积数据,而非归一化或浓度校准的代谢物测量值。未检测到的特征不应被解释为真实的生物学零浓度。

该数据集旨在支持相关研究的透明性和可重复性,该研究调查了HCV感染中的血浆代谢改变。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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