GSE96733：Ubc9过表达与SUMO1缺陷减轻肠道缺血再灌注后炎症

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE96733

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数据说明

肠上皮是抵御肠道菌群潜在致命影响的关键防御屏障。然而，由于存在复杂的底层血管系统，低灌注及由此导致的组织缺血对上皮的功能和完整性构成特殊风险。小泛素样修饰蛋白（SUMO）缀合途径对代谢应激的适应性反应具有关键调控作用，且在肠道中尤为重要，因为诱导性敲除SUMO缀合酶Ubc9会导致肠上皮迅速解体。本研究分析了肠上皮中各SUMO亚型的表达模式，并探讨其在肠道缺血/再灌注（I/R）损伤中的作用。免疫染色显示，在未受攻击的小鼠中，上皮SUMO2/3的表达几乎 exclusively 局限于隐窝上皮细胞核。然而，肠道I/R或Ubc9过表达导致沿隐窝-绒毛轴上上皮SUMO2/3染色显著增强。出乎意料的是，在SUMO1敲除小鼠中也发现了类似的模式。

Ubc9转基因小鼠以及SUMO1敲除小鼠均对缺血/再灌注损伤表现出保护作用，表现为屏障功能得到更好的保留以及炎症反应减弱。对显微切割的绒毛顶端上皮进行PCR阵列分析显示，Ubc9转基因小鼠炎症反应降低中有上皮细胞的特异性贡献，因为关键趋化信号分子如IL17A显著下调。总之，我们的数据表明尤其是SUMO2/3亚型在调节对缺血/再灌注的反应中发挥关键作用，并首次提供证据表明SUMO1缺失激活了一种代偿过程，从而保护免受缺血性损伤。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。