家族病例报告:C14orf132基因可能与IUGR及极低出生体重相关
该数据集来自NCBI GEO,标题为家族病例报告,探讨C14orf132基因与IUGR及极低出生体重的可能关联。研究以一个四口之家为对象,包括父母和两名极低出生体重表型子女,采用全基因组SNP分型芯片检测基因组重排,并利用RNA-seq评估全血转录组

基本信息
资源简介
家族病例报告:C14orf132基因可能与IUGR及极低出生体重相关
Family case report: C14orf132 gene is possibly related to IUGR and extremely low birth weight
该数据集来自NCBI GEO,标题为家族病例报告,探讨C14orf132基因与IUGR及极低出生体重的可能关联。研究以一个四口之家为对象,包括父母和两名极低出生体重表型子女,采用全基因组SNP分型芯片检测基因组重排,并利用RNA-seq评估全血转录组。数据包含1个文件,主题标签涉及高通量测序表达谱分析,可用于极低出生体重遗传病因的探索性研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 31 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:尽管进行了广泛研究,新生儿极低出生体重的遗传因素仍然不清楚。结果:本病例研究旨在识别导致新生儿极低出生体重(ELBW)和婴儿发育不良的候选基因。研究了一个四口之家:母亲、父亲和两名ELBW表型子女。研究是由于第二个孩子出生时和产后的医疗状况而进行的:特殊表型、微小异常、反复感染、疑似自身免疫性肝炎、多因素脑病,以及疑似代谢和染色体异常。使用外周血DNA样本,采用全基因组单核苷酸多态性(SNP)基因分型芯片研究两名患病儿童的基因组重排。使用RNA测序(RNA-seq)评估全血转录组。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL20148、9606。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE85013
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 06 202,引用时请注意版本时效。
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
背景:尽管已有大量研究,新生儿极低出生体重的遗传因素仍不明确。结果:本病例研究旨在识别导致新生儿极低出生体重(ELBW)及婴儿营养不良的候选基因。研究了一个四口之家:母亲、父亲和两名ELBW表型儿童。开展这些研究是由于第二名儿童出生时及产后的医学状况:特殊表型、微小异常、反复感染、疑似自身免疫性肝炎、多因素脑病,以及疑似代谢和染色体异常。采用全基因组单核苷酸多态性(SNP)基因分型芯片,利用外周血DNA样本研究两名患病儿童的基因组重排。通过RNA测序(RNA-seq)评估所有四名家庭成员的全血转录组。RNA-seq鉴定出单一基因——C14orf132存在差异表达,其转录本水平在儿童血液样本中显著降低。
拷贝数变异(CNV)分析未在两个患病儿童C14orf132基因区域发现任何致病性CNV。结论:我们展示了在病例研究中结合全基因组CNV和转录组分析以识别候选基因的重要性。我们提出C14orf132(14号染色体开放阅读框132)基因表达与ELBW表型相关。C14orf132基因是一种功能未知的新型长链非编码RNA(lincRNA),可能通过改变基因表达与发育迟缓相关。背景:尽管进行了广泛研究,新生儿极低出生体重的遗传因素仍不明确。结果:本病例研究旨在识别导致新生儿极低出生体重(ELBW)和婴儿发育不良的候选基因。研究了一个四口之家:母亲、父亲和两名ELBW表型
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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