Klinefelter综合征睾丸全基因组微阵列基因表达谱

该数据集为GSE54023,采用全基因组微阵列方法检测Klinefelter综合征(47,XXY)睾丸组织的基因表达谱,包含1个文件(GSE54023_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及表达谱芯片、GPL13693平台与9606物种

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL136939606
GSE54023: Klinefelter Syndrome testicular gene expression profile by a whole genome microarray approach.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-07

资源简介

Klinefelter综合征睾丸全基因组微阵列基因表达谱

Klinefelter Syndrome testicular gene expression profile by a whole genome microarray approach.

该数据集为GSE54023,采用全基因组微阵列方法检测Klinefelter综合征(47,XXY)睾丸组织的基因表达谱,包含1个文件(GSE54023_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及表达谱芯片、GPL13693平台与9606物种。数据可用于比较KS与对照睾丸组织的表达差异,探索睾丸退变相关分子机制,并为男性不育的遗传病因研究提供表达层面的线索(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 13 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:Klinefelter综合征(KS)是最常见的性染色体异常(47,XXY),也是男性不育的首要遗传原因。导致KS睾丸退变的机制仍不清楚,目前尚无针对患者的治疗方法。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL13693、9606。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE54023

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 20 201,引用时请注意版本时效。

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数据说明

目的:克氏综合征(KS)是最常见的性染色体异常(47,XXY),也是男性不育的首要遗传病因。导致KS睾丸退化的机制尚不清楚,目前尚无针对患者的治疗方法。本研究旨在揭示在精子发生障碍中发挥关键作用的分子信息。设计:对KS无精子症睾丸与正常睾丸进行基因表达谱分析,可为精子发生改变的分子基础提供有用信息。材料与方法:采用全基因组微阵列方法对6例无精子症非嵌合型KS男性和3例对照者的睾丸活检组织进行基因表达谱的转录组分析,共12次实验。使用T检验和错误发现率评估差异表达基因。通过Ingenuity Pathways Analysis软件分析已识别的转录本,以揭示基因的生物学功能。

结果:数据分析显示,与对照组相比,KS睾丸中与内分泌系统发育与功能、脂质代谢、生殖疾病、自由基清除及细胞死亡相关的基因分别有656个和247个出现差异性上调与下调表达。结论:综合这些数据表明,存在多个参与睾丸微环境失调的基因,导致生精失败。这一信息结合早期诊断,可能有助于揭示预防和限制睾丸功能障碍的潜在治疗靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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