小鼠肾脏组织：单侧输尿管梗阻小鼠与假手术对照

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE36496

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

引言与目的：肾功能丧失往往是肾脏梗阻需要手术干预的推动因素。梗阻性肾病以一系列离散的形态学和生理学改变为特征，包括肾小管扩张、细胞凋亡和萎缩，以及间质细胞浸润和进行性间质纤维化。我们假设，与梗阻性肾病相关的基因表达改变可作为早期干预的生物标志物。方法：对出生后第21天的C57BL/6小鼠实施单侧输尿管梗阻（UUO）或假手术，术后1、2、5和9天采集肾脏。从肾脏中提取RNA，并使用Agilent微阵列进行全面的基因表达谱分析。我们使用了生物学重复：13个UUO重复，9个假手术重复。双通道微阵列使用Cy3通道中的通用参考进行杂交。使用Ingenuity通路分析来分析基因表达数据的生物学功能和基因网络。

结果：微阵列分析显示，在梗阻后第1天至第9天，有超过1800个转录本表达上调或下调，其中包括许多先前报道过的转录本（FOS、CD44、CLU、SPP1和EGF）。通路分析显示，这些转录本在细胞活化/分化、免疫/炎症反应、细胞周期、代谢过程和转运等方面显著富集。有趣的是，IPA网络分析表明，涉及CEBPB/HNF4A的转录调控通路参与了梗阻性肾病。结论：转录谱分析鉴定了UUO后大量基因表达变化，并提示CEBPB/HNF4A通路在梗阻性肾病中的作用。该数据集为开发梗阻性肾病的生物标志物提供了基础。时间：术后收集样本的天数 体细胞修饰：对小鼠进行手术以产生尿道梗阻

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。