老年与年轻野生型小鼠肾脏转录组（RNA-seq）
该数据集为老年（28-32月龄）与年轻（3月龄）野生型C57BL/6J小鼠肾脏组织的bulk RNA-seq数据，用于刻画自然衰老相关的转录变化，并与慢性NAD缺乏ANDY小鼠（无烟酸饮食NFD vs CD，另存为recovery_kidney SubSeries）的转录改变进行比较
基本信息
资源简介
老年与年轻野生型小鼠肾脏转录组（RNA-seq）
GSE345593 数据集收录的是野生型 C57BL/6J 小鼠肾脏组织的 bulk RNA-seq 数据，样本涵盖老年（28–32 月龄）与年轻（3 月龄）两组，目的是刻画自然衰老过程中肾脏转录组的变化。该数据集同时为一项关于慢性 NAD 缺乏小鼠模型的研究提供支持，使自然衰老相关的转录改变能够与慢性 NAD 缺乏条件下的转录改变进行比较。数据集以单个压缩的系列矩阵文件形式提供，属于基因表达谱类数据，来源于 NCBI，本站归类于内分泌、营养和代谢疾病下的其他类别。
【数据集背景】
该数据集围绕自然衰老对肾脏转录组的影响而构建。研究采集老年（28–32 月龄）与年轻（3 月龄）野生型 C57BL/6J 小鼠的肾脏组织进行 bulk RNA-seq，用于表征与自然衰老相关的转录变化。这些数据还被用于与慢性 NAD 缺乏的 ANDY 小鼠模型中所观察到的转录改变进行比较；该 ANDY 模型饲喂无烟酸饮食（NFD），并以对照饮食（CD）作为参照，相关数据另行存放为 recovery_kidney SubSeries。数据集是为支持 Benitez-Rosendo, A. & Feuz, M. B. 等人的研究论文《Inducible chronic NAD deficiency in mice reveals multi-systemic phenotypical, metabolic, and transcriptional changes》（Nature Communications，修回中，稿号 NCOMMS-26-053722-T）而生成，对应论文 Fig. 6e-h。
【数据内容】
数据内容为小鼠肾脏组织的基因表达谱，采用高通量测序方式进行表达谱分析。样本按年龄分为老年组（28–32 月龄）与年轻组（3 月龄），均为野生型 C57BL/6J 小鼠。数据集共包含 1 个文件，文件名为 GSE345593_series_matrix.txt.gz，即压缩后的系列矩阵文件，通常以矩阵形式组织样本与表达信息。主题标签涉及 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL30172 与 10090，分别指向高通量测序表达谱、所用平台以及小鼠这一物种。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov。生物样本为野生型 C57BL/6J 小鼠的肾脏组织，按老年与年轻两个年龄段采集后进行 bulk RNA-seq。数据作者为 Morgan, B, Feuz。发布时间为 Aug 31 202（源站所载日期原文如此）。
【适用场景】
该数据集适用于研究自然衰老过程中肾脏转录组的变化，也适用于将自然衰老相关的转录改变与慢性 NAD 缺乏模型（ANDY 小鼠，NFD 与 CD 比较）中的转录改变进行对照分析。对于关注衰老、肾脏基因表达调控以及 NAD 代谢相关转录效应的研究者，该数据可作为表达谱层面的参考数据使用。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE345593_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。
【质量与限制】
源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE345593
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对老年（28-32个月）和年轻（3个月）野生型C57BL/6J小鼠的肾脏组织进行RNA测序，用于表征与自然衰老相关的转录变化。采集肾脏进行bulk RNA-seq，以将年龄相关的转录变化与在喂食无烟酸饮食的ANDY小鼠中观察到的慢性NAD缺乏相关变化进行比较（NFD vs CD；作为recovery_kidney SubSeries另行提交）。该数据集旨在支持：Benitez-Rosendo, A. & Feuz, M. B. 等，‘Inducible chronic NAD deficiency in mice reveals multi-systemic phenotypical, metabolic, and transcriptional changes.’ Nature Communications（修订中；NCOMMS-26-053722-T）（图6e-h）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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