ANDY小鼠无烟酸饮食及饮食恢复后的肾脏转录组(RNA-seq)

该数据集为ANDY小鼠肾脏组织的bulk RNA-seq数据,ANDY小鼠是携带多西环素诱导型人ACMSD表达的转基因小鼠,获得对膳食烟酸的依赖以合成NAD

geo
浏览 9
基因组预测GPL3017210090
GSE345345: Kidney transcriptome of ANDY mice on niacin-free diet and following dietary recovery (RNA-seq)

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

ANDY小鼠无烟酸饮食及饮食恢复后的肾脏转录组(RNA-seq)

Kidney transcriptome of ANDY mice on niacin-free diet and following dietary recovery (RNA-seq)

该数据集为ANDY小鼠肾脏组织的bulk RNA-seq数据,ANDY小鼠是携带多西环素诱导型人ACMSD表达的转基因小鼠,获得对膳食烟酸的依赖以合成NAD。雄性ANDY小鼠经饮水给予多西环素,分别维持21周烟酸充足对照饮食(CD)或无烟酸饮食(NFD)以诱导慢性NAD缺乏,或先维持NFD 15周再切换至CD 6周以评估恢复(Rec)。实验终点采集肾脏进行RNA-seq,用于表征与NAD缺乏及饮食恢复相关的转录变化,支持相关研究发表(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 28 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):对ANDY小鼠(携带多西环素诱导型人ACMSD表达的转基因小鼠,获得对膳食烟酸的依赖以合成NAD)肾脏组织进行RNA测序。雄性ANDY小鼠在饮水中接受多西环素,并维持21周烟酸充足对照饮食(CD)或无烟酸饮食(NFD)以诱导慢性NAD缺乏,或维持NFD 15周后切换至CD 6周以评估恢复(Rec)。在喂养试验结束时采集肾脏进行bulk RNA-seq,以表征与NAD缺乏及饮食恢复相关的转录变化(Fig. 5a;Supplementary Fig. 5h-k)。该数据集为支持以下研究而生成:Benitez-Rosendo, A. & Feuz, M. B. et al. 'Inducible chronic NAD deficiency in mice reveals multi-systemic phenotypical, metabolic, and transcriptional changes.' Nature Communications (i

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL30172、10090。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE345345

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 08 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE345345

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对ANDY小鼠(一种转基因小鼠,其携带受多西环素诱导表达的人源ACMSD,从而获得对膳食烟酸的依赖性以合成NAD)的肾脏组织进行了RNA测序。雄性ANDY小鼠在饮水中给予多西环素,并分别维持以下处理21周:烟酸充足对照饮食(CD)或烟酸缺乏饮食(NFD)以诱导慢性NAD缺乏;或先维持NFD 15周后转为CD 6周以评估恢复情况(Rec)。在喂养试验结束时采集肾脏进行bulk RNA-seq,以表征与NAD缺乏及饮食恢复相关的转录变化(图5a;补充图5h-k)。该数据集为以下研究提供支持:Benitez-Rosendo, A. & Feuz, M. B. 等,‘Inducible chronic NAD deficiency in mice reveals multi-systemic phenotypical, metabolic, and transcriptional changes.’ Nature Communications(修订中;NCOMMS-26-053722-T)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案