GSE344570：TGF-β通过抑制c-Myc和代谢重编程在OM10.1细胞中维持HIV静息

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE344570

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数据说明

抗逆转录病毒治疗（ART）可抑制HIV复制，但无法清除持续存在的病毒储存库，治疗中断后病毒血症可迅速重新出现。我们此前已证明，体内阻断转化生长因子β（TGF-β）信号通路可促进SIV潜伏逆转，并与细胞代谢静息状态的逆转相关。本研究利用前病毒感染的早幼粒细胞系OM10.1，探讨TGF-β调控HIV再激活的细胞内在机制。TGF-β抑制了由不同潜伏逆转剂刺激后的前病毒再激活，而药理学抑制TGF-β信号通路可逆转这一效应。TGF-β减少了HIV转录，但未抑制TNF-α诱导的NF-κB活化，提示其通过替代机制发挥抑制作用。批量RNA测序显示，Myc相关通路、糖酵解、氧化磷酸化及mTORC1信号传导受到广泛抑制。功能性代谢谱分析证实，糖酵解和线粒体ATP生成均显著降低，线粒体膜极化减弱。

与代谢和病毒再激活之间的功能性联系相一致，线粒体解偶联强烈抑制了HIV表达。最后，MYC过表达完全恢复了HIV转录，并部分恢复了TGF-β处理细胞中的p24产生。总之，这些发现确定了一种细胞内在机制，通过该机制，TGF-β通过施加代谢静止状态来限制HIV再激活，至少部分是通过抑制Myc介导的。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。