宿主适应以生物膜形成为代价驱动主要人类真菌病原体暴发持续 [巨噬细胞]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE344550

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

近平滑念珠菌是一种重要的人类真菌病原体，近期全球暴发由耐药（DR-Cp）分离株驱动，这些菌株难以清除且与不良临床结局相关。然而，这些暴发菌株持续存在的微生物学特征仍知之甚少。在此，我们显示，导致多个国家持续暴发的DR-Cp分离株表现出显著的低生物膜产生（LBP）表型。出乎意料的是，LBP菌株表现出增强的应激耐受性、细胞壁遮蔽和免疫逃逸，从而导致对中性粒细胞和巨噬细胞杀伤的抵抗，并在系统性感染期间于免疫细胞丰富的器官中存活增加。全基因组转录组分析揭示了LBP菌株中广泛的代谢和调控重编程，而对全球分离株集合的全基因组测序（WGS）表明，LBP表型已多次独立出现。功能遗传分析鉴定了一个此前未表征的转录因子，其突变显著减少生物膜形成，但同时增强宿主免疫相互作用期间的适应性。

我们的研究结果共同挑战了主流观点，即强大的生物膜形成是念珠菌疫情持续存在的根本原因，反而揭示了宿主免疫压力会选择生物膜减弱的适应性策略，从而促进长期持续存在。这些见解重新定义了近平滑念珠菌在医疗保健相关疫情期间的适应方式，并通过将注意力转向非环境储库，为感染控制策略提供了依据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。