原发性BPH基质细胞培养显示增强的雄激素反应性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE344492

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数据说明

背景：良性前列腺增生（BPH）是老年男性中最常见的疾病。BPH的生长依赖于雄激素，并且与正常前列腺相比，雄激素似乎优先刺激BPH的生长。雄激素优先刺激BPH生长的机制尚不清楚。我们先前的研究表明，在3D共培养中，原代BPH基质细胞（而非同一患者配对的正常邻近前列腺（NAP）基质细胞）能够刺激前列腺上皮细胞增殖。然而，雄激素对前列腺基质细胞的调控在BPH结节中是否发生改变尚不清楚。方法：从同一患者制备配对的BPH和NAP原代基质细胞。对早期传代的配对BPH和NAP原代细胞用雄激素和/或抗雄激素处理，进行RNA-seq分析。RNA-seq数据采用主成分分析（PCA）和功能富集分析。将配对BPH和NAP原代细胞在存在或不存在雄激素条件下的条件培养基用于良性前列腺上皮细胞的三维（3D）培养。

结果：RNA-seq数据分析表明，与配对的NAP基质细胞相比，BPH原代基质细胞中雄激素诱导的基因表达增强。BPH基质细胞中的AR激活似乎增强了细胞运动、血管和细胞外基质重塑以及旁分泌信号传导，同时调节细胞周期和代谢过程。与常规BPH基质条件培养基相比，雄激素刺激的BPH基质细胞条件培养基进一步增强了3D培养中前列腺上皮细胞的增殖。相反，在雄激素存在下培养的NAP基质细胞条件培养基对3D培养中前列腺上皮细胞增殖无显著影响。结论：我们的研究结果表明，雄激素通过旁分泌前列腺基质信号传导刺激前列腺上皮细胞生长的作用增强

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。