犬与人肝细胞在醋氨酚、双氯芬酸或丙戊酸处理下细胞色素P450酶活性与mRNA表达比较

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE343519

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

重要性：尽管已在啮齿动物和人类中对细胞色素P450（CYP）酶进行了大量研究，但关于犬CYP酶的研究仍然有限。缺乏针对犬的物种特异性代谢研究，是预测毒性和药物不良反应方面的一大挑战。目的：本研究旨在考察犬与人类肝细胞在接受对乙酰氨基酚（AAP）、双氯芬酸（Dic）或丙戊酸（VPA）处理后，CYP酶活性及mRNA表达的种间差异。方法：我们测定了AAP、Dic和VPA在犬与人类肝细胞中的24小时暴露半数抑制浓度（IC50）值。基于这些IC50浓度，我们比较了药物诱导的各项参数变化，包括免疫细胞化学、转录组谱（RNA-seq）和CYP活性，以评估基因和蛋白质水平的变化。结果：在犬肝细胞中，AAP和VPA分别使CYP2J2 mRNA表达增加4.7倍和7.76倍，而Dic使CYP1A1 mRNA表达增加14.25倍。AAP、VPA和Dic分别使犬肝细胞中CYP26B1 mRNA表达降低0.03倍、0.12倍和0.17倍。

Dic和VPA分别使CYP1A1 mRNA表达增加5.53倍和6.66倍，而AAP、VPA和Dic分别使CYP4F22 mRNA表达降低0.03倍、0.13倍和0.13倍（在人肝细胞中）。结论与意义：观察到的物种间在药物暴露后CYP活性和mRNA水平上的差异，凸显了准确精确的实验模型对新药研发的重要性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。