Acanthamoeba castellanii Neff 株氧气与营养扰动表达谱
研究对 Acanthamoeba castellanii Neff 株进行互补的蛋白质组与转录组分析，考察其对缺氧、无氧、复氧、碳水化合物变化（葡萄糖、甘油、半乳糖、无碳水化合物）以及铁变化（三价铁、二价铁、无补充铁）的响应，本数据集报告的是 bulk RNA-seq 转录组数据
基本信息
资源简介
Acanthamoeba castellanii Neff 株氧气与营养扰动表达谱
Oxygen and nutrient perturbation profiling of Acanthamoeba castellanii strain Neff
该数据集来自 NCBI，标题为 Oxygen and nutrient perturbation profiling of Acanthamoeba castellanii strain Neff，包含 1 个文件 GSE338845_series_matrix.txt.gz。研究对 Acanthamoeba castellanii Neff 株进行互补的蛋白质组与转录组分析，考察其对缺氧、无氧、复氧、碳水化合物变化（葡萄糖、甘油、半乳糖、无碳水化合物）以及铁变化（三价铁、二价铁、无补充铁）的响应，本数据集报告的是 bulk RNA-seq 转录组数据。可用于研究该生物在氧气与营养扰动下的基因表达变化（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jul 16 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：变形虫 Acanthamoeba castellanii 是感染性失明的重要病因，也是人类和真菌的关键演化外群。我们进行了互补的蛋白质组学和转录组学分析，以确定该生物如何响应缺氧、无氧、复氧、碳水化合物变化（葡萄糖 vs 甘油 vs 半乳糖 vs 无碳水化合物）以及铁变化（三价铁 vs 二价铁 vs 无补充铁）。此处报告的是 bulk RNA-seq 转录组学数据。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL37229、5755。本站分类：内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE338845
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 01 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE338845
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
变形虫类阿米巴棘阿米巴是感染性失明的重要病因，也是人类和真菌的关键演化外群。我们进行了互补的蛋白质组学和转录组学分析，以确定该生物如何响应缺氧、无氧、复氧、碳水化合物变化（葡萄糖 vs 甘油 vs 半乳糖 vs 无碳水化合物）以及铁变化（三价铁 vs 二价铁 vs 无补充铁）。批量RNA-seq转录组学数据在此报告。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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