产前大麻烟雾暴露后小鼠胎盘基因表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE337449

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

产前大麻使用正在增加，但吸入大麻烟雾对胎盘分子功能的影响仍不明确。本研究的目标是使用生理相关的吸入模型，表征产前大麻烟雾暴露后胎盘转录组学的改变。将定时妊娠的CD1小鼠从胚胎第6.5天至胚胎第18.5天暴露于大麻香烟烟雾或室内空气中。在胚胎第18.5天收集胎盘组织，并使用Affymetrix Clariom S Mouse微阵列进行分析。该数据集包括来自对照组和大麻烟雾暴露妊娠的14个胎盘样本，并将胎儿性别作为生物学变量纳入。使用线性模型并采用错误发现率校正分析差异基因表达。进行通路富集分析和基因集变异分析，以识别生物学和区室相关的转录组学变化。通过定量PCR验证选定基因。大规模转录组学谱显示，按暴露情况未见明显聚类；然而，在错误发现率<0.05且绝对log2倍数变化>0.5的阈值下，有23个基因发生显著改变。

通路分析显示，氧化磷酸化、脂肪酸代谢和跨膜转运整体受到抑制，同时RNA加工和应激反应通路富集。基因集变异分析表明，暴露胎盘中的迷路区相关特征减少，而连接区相关特征增加。定量PCR证实了多个转运相关基因表达的改变。总之，这些发现表明，产前大麻烟雾暴露诱导了微妙但协调的胎盘转录组重编程，其特征是代谢和转运通路受损以及区室特异性活动的改变。该数据集提供了关于吸入大麻暴露如何可能损害胎盘功能并导致不良妊娠结局的机制性见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。