特应性皮炎年龄组免疫差异的单细胞多组学数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE332623

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：特应性皮炎（AD）可发生于所有年龄段，但在儿童、成人和老年人之间表现出不同的临床和免疫学特征。这些年龄特异性免疫差异背后的分子程序仍知之甚少。方法：我们对29例AD患者和29例匹配的健康对照（HC）的外周血单个核细胞（PBMC）进行了单细胞多组学分析，涵盖儿童（0–17岁）、成人（18–59岁）和老年（≥60岁）组。采用基于测序的转录组和表位细胞索引（CITE-seq）技术，我们同时量化了约280,000个免疫细胞的转录组（RNA）和表面蛋白质组（ADT）图谱。综合分析确定了30个免疫亚群，用于细胞类型比例和差异表达分析。基于显著的基因和蛋白质特征训练机器学习分类器，以按年龄区分AD亚组。结果：与HC相比，AD血液显示CD14+单核细胞、浆细胞样树突状细胞和CD4+增殖性T细胞富集，AD与HC的差异基因表达分析揭示了在所有年龄组中共有的下游Th2相关特征。

在AD中，儿童患者γδ T细胞、初始CD4+和初始CD8+ T细胞增多，而老年患者则表现出更多的CD4+细胞毒性T细胞和CD8+中央记忆T细胞，表明随着年龄增长，免疫优势从初始细胞向效应细胞转变。转录组学和蛋白质组学分析揭示了不同的程序：儿童AD富集IL-10和细胞因子-细胞因子受体信号传导；成人AD表现出代谢和核因子κB（NF-κB）/Th1/Th17通路的激活；老年AD则表现为适应性免疫活性降低但先天信号传导增强。基于差异表达基因和蛋白质的机器学习模型能够准确分类AD年龄组（基于转录本的F1 = 0.70，AUC = 0.79），识别出稳定的标志

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。