BCG+BLP训练免疫中CCR5hi单核细胞的代谢-表观重编程[scRNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE331226

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

训练免疫通过赋予单核细胞类记忆特性来增强固有宿主防御，但其潜在的代谢与表观遗传整合机制仍不明确。在此，我们证明卡介苗（BCG）与细菌脂蛋白（BLP）联合免疫可诱导一种持久形式的训练免疫，从生命早期到成年期提供针对多微生物脓毒症的强效长期保护。单细胞RNA测序揭示，该效应由具有增强抗菌能力的CCR5hi类记忆单核细胞扩增所介导。机制上，BCG+BLP疫苗接种激活了AKT–mTOR–HIF-1α轴，驱动糖酵解重编程及随后的乳酸积累。我们发现，升高的乳酸随后促进KAT2B依赖的组蛋白H3K18乳酰化，这一表观遗传标记直接促进吞噬和炎症基因的转录。关键的是，从接种疫苗的人脐带血中分离的CCR5hi单核细胞重现了这些乳酸驱动的乳酰化和训练免疫特征。

综合而言，我们的发现界定了一条新的乳酸–KAT2B–H3K18la表观遗传轴，该轴协调CCR5hi单核细胞的长期重编程，突显CCR5hi单核细胞作为调控先天免疫以对抗致死性脓毒症的有前景的治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。