GSE327270:Semaglutide 在 HIV 相关脂肪增生随机试验中减缓表观遗传衰老
数据为 HIV 感染者 PBMC 样本的全基因组 DNA 甲基化图谱,采用 genome tiling array 甲基化检测,平台为 GPL33022,物种为 9606

基本信息
资源简介
GSE327270:Semaglutide 在 HIV 相关脂肪增生随机试验中减缓表观遗传衰老
Semaglutide Slows Epigenetic Aging in a Randomized Trial of HIV-Associated Lipohypertrophy
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 Semaglutide Slows Epigenetic Aging in a Randomized Trial of HIV-Associated Lipohypertrophy,属于内分泌、营养和代谢疾病 / 其他分类。数据为 HIV 感染者 PBMC 样本的全基因组 DNA 甲基化图谱,采用 genome tiling array 甲基化检测,平台为 GPL33022,物种为 9606。数据集仅含 1 个文件,样例为 GSE327270_series_matrix.txt.gz,作者为 Michael J Corley。可用于研究 HIV 相关脂肪增生人群的表观遗传衰老特征,以及 Sem。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 07 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):HIV感染者PBMC样本的全基因组DNA甲基化谱分析
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL33022、9606。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327270
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 25 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327270
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
对HIV感染者外周血单核细胞样本进行全基因组DNA甲基化谱分析。HIV-1感染影响生物学衰老,表观遗传时钟突显了HIV感染者表观遗传年龄的加速。尽管有证据表明胰高血糖素样肽-1受体激动剂在改善HIV相关心血管代谢结局方面有益,但其对HIV表观遗传研究中衰老生物标志物的影响仍是一个重大的知识空白。因此,我们构建了一个具有代表性的表观遗传数据集,以探究胰高血糖素样肽-1受体激动剂在表观遗传衰老中的作用及其与临床表型的关系。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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