克氏锥虫感染小鼠滤泡细胞毒性CD8+ T细胞的RNA测序
该数据集为克氏锥虫感染小鼠滤泡细胞毒性CD8+ T细胞的RNA测序数据,来源于NCBI GEO,包含1个文件GSE319904_series_matrix.txt.gz

基本信息
资源简介
克氏锥虫感染小鼠滤泡细胞毒性CD8+ T细胞的RNA测序
RNA sequencing of Follicular Cytotoxic CD8+ T Cells from Trypanosoma cruzi-infected mice
该数据集为克氏锥虫感染小鼠滤泡细胞毒性CD8+ T细胞的RNA测序数据,来源于NCBI GEO,包含1个文件GSE319904_series_matrix.txt.gz。研究以急性克氏锥虫感染为系统性免疫激活模型,比较脾脏与腹股沟淋巴结中Tfc细胞的表型、转录组、代谢及功能特征,发现Tfc细胞在两器官中短暂出现且动力学与抗原特异性相似,但转录水平主要按组织来源分离,脾脏Tfc细胞表现出增强的糖酵解和mTORC1相关特征、线粒体质量增加及更强的细胞毒性。数据可用于免疫学与感染性疾病研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 18 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):滤泡细胞毒性CD8? T(Tfc)细胞是CD8? T淋巴细胞的一个特殊亚群,兼具辅助和细胞毒性功能。虽然其表型和功能特性已在多种感染和炎症环境中被描述,但Tfc细胞在不同次级淋巴器官中是否表现出不同特征尚不清楚。以急性克氏锥虫感染作为系统性免疫激活模型,我们对脾脏和腹股沟淋巴结中出现的Tfc细胞进行了比较性的表型、转录组、代谢和功能表征。Tfc细胞在两个器官中短暂出现,动力学和抗原特异性相似,但在转录水平上主要按分析组织分离。脾脏Tfc细胞表现出增强的糖酵解和mTORC1相关特征、线粒体质量增加以及更强的细胞毒性
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL34328、10090。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319904
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 22 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
滤泡细胞毒性CD8? T(Tfc)细胞是CD8? T淋巴细胞的一个特化亚群,兼具辅助和细胞毒性功能。尽管其表型和功能特性已在多种感染和炎症环境中得到描述,但Tfc细胞在次级淋巴器官之间是否表现出不同特征尚知之甚少。以急性克氏锥虫感染作为系统性免疫激活模型,我们对脾脏和腹股沟淋巴结中产生的Tfc细胞进行了表型、转录组、代谢和功能的比较性表征。Tfc细胞在两个器官中均以相似的动力学和抗原特异性短暂出现,但在转录水平上主要按分析组织进行区分。脾脏Tfc细胞表现出增强的糖酵解和mTORC1相关特征、线粒体质量增加以及更强的细胞毒性和B细胞辅助功能,促进免疫球蛋白产生和浆母细胞死亡。
相比之下,来自淋巴结的Tfc细胞优先表现出记忆相关特征,包括更高的CD127和CD122表达、增加的IL-2产生,以及在慢性感染期间优先持续存在。总之,这些发现表明,来自脾脏和淋巴结的Tfc细胞群具有不同的转录、代谢和功能状态。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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