日本虻唾液腺RNA-seq分析数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE319147

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

日本虻是一种在夏季活动频繁的吸血昆虫，其唾液腺分泌物在成功吸血过程中起着关键的介导作用。本研究采集了夏季活动高峰期3只日本虻的混合唾液腺样本，用于RNA-seq分析。测序前在无菌低温条件下提取总RNA。双端测序共产生45,310,280条原始读序，其中88.75%的读序成功比对。从头组装获得35,175条unigene，将其比对至Swiss-Prot数据库以获得UniProt ID。这些ID映射至GO数据库，并归类为三个GO类别；功能注释显示其富集于代谢、膜相关生物过程以及结合/催化分子活性，这些功能支撑了抗凝血唾液成分的合成与分泌，而该成分对于吸血适应和微生物胁迫抗性至关重要。与KEGG数据库比对后获得KEGG ID，映射后得到唯一KO，随后进行了KEGG富集分析。

这个高质量的转录组数据集代表了T. nipponicus的首个基因表达谱，它建立在以往实验基础之上，为理解虻类的关键生理过程提供了宝贵见解，包括抗凝血、血餐消化、抗氧化防御、与哺乳动物宿主免疫互作以及微生物抵抗等方面。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。