日光性黑子脂质代谢失调的多系统层面分析:膜不稳定与能量稳态破坏

该数据集来自 NCBI,包含日光性黑子病变与对照皮肤样本的 RNA 测序数据(每组 n=7),通过代谢通量模拟、基因共表达网络和蛋白-蛋白互作分析,系统研究脂质代谢在日光性黑子发病中的作用

geo
浏览 13
基因组分类GPL246769606
GSE318414: Lipid metabolism dysregulation in solar lentigo: a multi-system-level analysis reveals membrane instability and energy homeostasis disruption

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

日光性黑子脂质代谢失调的多系统层面分析:膜不稳定与能量稳态破坏

Lipid metabolism dysregulation in solar lentigo: a multi-system-level analysis reveals membrane instability and energy homeostasis disruption

该数据集来自 NCBI,包含日光性黑子病变与对照皮肤样本的 RNA 测序数据(每组 n=7),通过代谢通量模拟、基因共表达网络和蛋白-蛋白互作分析,系统研究脂质代谢在日光性黑子发病中的作用。数据揭示脂肪酸延伸、乙酰辅酶A羧化酶活性及鞘脂生物合成受到协同抑制,并涉及膜不稳定与能量稳态破坏。可用于探索脂质代谢通路改变、筛选潜在标志物及研究光老化相关色素性皮肤病的分子机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Feb 04 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):日光性黑子是一种常见的色素沉着性皮肤病,由慢性紫外线暴露引起,主要影响光老化皮肤。既往研究集中于炎症和黑色素生成机制,而脂质代谢在发病机制中的综合作用仍不清楚。我们旨在研究脂质代谢的系统性改变及其对日光性黑子发生发展的贡献。我们利用代谢通量模拟、基因共表达网络和蛋白-蛋白相互作用分析,对日光性黑子病变和对照皮肤样本(每组 n=7)的 RNA 测序数据进行了综合分析。这些多系统方法被整合用于识别脂质代谢通路中的协同改变。日光性黑子样本表现出脂肪酸延伸、乙酰辅酶A羧化酶活性和鞘脂生物合成的协同抑制,以及

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318414

【使用注意】

· 源站最后修改于 Apr 10 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318414

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

日光性黑子是常见的色素沉着性皮肤病,由慢性紫外线暴露引起,主要累及光老化皮肤。既往研究多聚焦于炎症和黑素生成机制,而脂质代谢在发病机制中的综合作用尚不明确。本研究旨在探讨脂质代谢的系统性改变及其在日光性黑子发生中的贡献。我们利用代谢通量模拟、基因共表达网络和蛋白质-蛋白质相互作用分析,对日光性黑子皮损及对照皮肤样本(每组n=7)的RNA测序数据进行了综合分析。这些多系统方法被整合用于识别脂质代谢通路中的协同性改变。日光性黑子样本表现出脂肪酸延长、乙酰辅酶A羧化酶活性和鞘脂生物合成的协同性抑制,同时通过角鲨烯环氧酶和7-脱氢胆固醇还原酶活性降低导致胆固醇合成受损。观察到磷脂合成酶和二氢神经酰胺去饱和酶的代偿性上调。

通路破坏和钙信号改变,表明细胞能量代谢异常和膜完整性受损。这些发现表明,日光性黑子病的发病机制涉及超越黑素生成之外的系统性脂质代谢失调,导致膜不稳定、能量稳态破坏和氧化还原失衡。特定代谢瓶颈的识别揭示了色素性疾病中基于脂质的治疗方法的新的靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案