GSE316690：3-羟基丙酸通过GAPDH羧乙基化将炎性巨噬细胞糖酵解转化为线粒体氧化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE316690

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

巨噬细胞响应环境刺激动态重编程其代谢状态，从而发挥不同的免疫功能。在我们的初步研究中，一种肠道微生物群衍生代谢物3-羟基丙酸（3-HPA）在慢性炎症中升高，并生成半胱氨酸羧乙基化新抗原。然而，这种代谢物诱导的修饰在调节巨噬细胞功能中的作用仍不清楚。在此，我们证明3-HPA在脓毒症小鼠模型中减轻炎症并抑制巨噬细胞炎症反应。机制上，3-HPA诱导甘油醛-3-磷酸脱氢酶（GAPDH）羧乙基化，通过泛素-蛋白酶体途径促进GAPDH降解，从而抑制其酶活性和表达以抑制糖酵解。同时，GAPDH活性降低升高NAD+/NADH比值，通过上调精氨酸生物合成和TCA循环途径增强线粒体氧化。综上所述，我们的研究揭示了GAPDH羧乙基化介导代谢重编程并在炎症巨噬细胞活化过程中调节炎症的机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。