DHT处理后原代间皮细胞中雄激素受体结合位点全基因组图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309339

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

内脏脂肪组织（VAT）由单层间皮细胞包被，间皮细胞以其保护和修复功能而著称。然而，间皮细胞更广泛的功能作用，尤其是在代谢背景下的作用，仍鲜有探索。在高雄激素血症女性中，我们观察到VAT内间皮层的破坏以及间皮细胞丰度的显著减少。鉴于高雄激素血症主要表现为双氢睾酮（DHT）水平升高，而DHT通过雄激素受体（AR）激活信号传导，我们推测异常的AR信号传导导致了间皮细胞功能障碍。为鉴定介导这一效应的AR直接基因组靶点，我们采用基于AR抗体的Cut&Tag测序方法，对接受或未接受DHT处理的雌性小鼠原代间皮细胞中的AR结合位点进行了全基因组分析。我们的分析揭示Inmt基因是AR信号传导的关键下游靶点。我们提出，AR对Inmt的结合及转录调控导致内质网（ER）应激和凋亡通路的激活，最终促进间皮细胞凋亡。

该数据集提供了间皮细胞中AR顺反子组的全面图谱，并为高雄激素血症与内脏脂肪组织间皮细胞丢失之间的分子机制提供了关键见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。