FGL2刺激肠神经嵴细胞的转录组分析:探究Hirschsprung病代谢失调
该数据集包含原代小鼠肠神经嵴细胞(ENCCs)在FGL2刺激与未处理对照下的bulk RNA测序数据。数据可用于识别FGL2诱导的转录变化和信号通路改变,为研究FGL2介导的代谢失调在Hirschsprung病发病机制中的作用提供线索(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
FGL2刺激肠神经嵴细胞的转录组分析:探究Hirschsprung病代谢失调
Transcriptome profiling of FGL2-stimulated enteric neural crest cells to investigate metabolic dysregulation in Hirschsprung disease pathogenesis
该数据集包含原代小鼠肠神经嵴细胞(ENCCs)在FGL2刺激与未处理对照下的bulk RNA测序数据。ENCCs取自胚胎期14–15天C57BL/6J小鼠,培养后P75和nestin标记表达>95%。FGL2刺激后提取总RNA,使用NEBNext Ultra RNA Library Prep Kit建库,在Illumina NovaSeq 6000平台进行双端测序(2×150 bp)。数据可用于识别FGL2诱导的转录变化和信号通路改变,为研究FGL2介导的代谢失调在Hirschsprung病发病机制中的作用提供线索(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 11 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含来自原代小鼠肠神经嵴细胞(ENCCs)的bulk RNA测序数据,这些细胞经纤维蛋白原样蛋白2(FGL2)刺激或作为未处理的对照。ENCCs从胚胎第14–15天的C57BL/6J小鼠中分离,并在确定条件下培养,以确保P75和nestin标记的表达>95%。FGL2刺激后,提取总RNA,并使用NEBNext Ultra RNA Library Prep Kit for Illumina制备测序文库。在Illumina NovaSeq 6000平台上进行双端测序(2 × 150 bp)。该研究旨在识别FGL2在ENCCs中诱导的转录变化和信号通路改变,为FGL2介导的代谢失调在Hirschsprung病发病机制中的作用提供见解。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305114
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 11 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含原代小鼠肠神经嵴细胞(ENCCs)的bulk RNA测序数据,这些细胞经纤维蛋白原样蛋白2(FGL2)刺激或以未处理作为对照。ENCCs从胚胎第14–15天的C57BL/6J小鼠中分离,并在限定条件下培养,以确保P75和nestin标记物的表达率大于95%。FGL2刺激后,提取总RNA,并使用NEBNext Ultra RNA Library Prep Kit for Illumina制备测序文库。在Illumina NovaSeq 6000平台上进行双端测序(2 × 150 bp)。本研究旨在鉴定FGL2在ENCCs中诱导的转录变化和信号通路改变,为FGL2介导的代谢失调在先天性巨结肠发病机制中的作用提供见解。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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