血红素对镰状细胞病外周血单核细胞来源红系祖细胞基因表达的影响

该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个系列矩阵文件,记录血红素处理镰状细胞病外周血单核细胞来源红系祖细胞在低氧条件下的转录组表达谱,并涉及 DMKG、DMF 等化合物干预的基因表达数据

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时间序列预测GPL185739606
GSE302368: Effect of hemin on gene expression in erythroid progenitors derived from human sickle cell disease peripheral blood mononuclear cells (PBMC)

基本信息

模态
时间序列
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

血红素对镰状细胞病外周血单核细胞来源红系祖细胞基因表达的影响

Effect of hemin on gene expression in erythroid progenitors derived from human sickle cell disease peripheral blood mononuclear cells (PBMC)

该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个系列矩阵文件,记录血红素处理镰状细胞病外周血单核细胞来源红系祖细胞在低氧条件下的转录组表达谱,并涉及 DMKG、DMF 等化合物干预的基因表达数据。数据可用于分析血红素对红系祖细胞基因表达的影响、探索 NRF2 介导的抗氧化与抗铁死亡信号通路,以及评估潜在缓解化合物的保护作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 11 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):镰状细胞病持续遭受慢性溶血和全身性低氧状况。SCD 患者存在富马酸、谷氨酸、甘氨酸、苹果酸及其他参与糖酵解、核苷酸分解代谢和谷胱甘肽代谢的代谢物的异常代谢调节。为研究血红素对来源于 SCD PBMC 的红系祖细胞(EPs)的影响,在低氧条件(1% O2)下探究了血红素处理的 SCD EPs 的转录组。同时,为探索可减轻血红素作用的化合物,研究了二甲基α酮戊二酸(DMKG)、富马酸二甲酯(DMF)的基因表达谱。我们发现 DMKG 和 DMF 通过诱导 NRF2 介导的抗氧化信号表达,对血红素表现出保护作用。NRF2 激活诱导细胞抗铁死亡反应,以提高 SCD EPs 的活力和增殖。我们的发现表明 DMF

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18573、9606。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE302368

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 17 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

镰状细胞病持续存在慢性溶血和全身缺氧状态。SCD患者的延胡索酸、谷氨酸、甘氨酸、苹果酸以及其他参与糖酵解、核苷酸分解代谢和谷胱甘肽代谢的代谢物存在代谢调控异常。为研究血红素对来源于SCD PBMC的红系祖细胞(EPs)的影响,我们在缺氧条件(1% O2)下探究了经血红素处理的SCD EPs的转录组。同时,为探索可减轻血红素作用的化合物,研究了二甲基α-酮戊二酸(DMKG)和二甲基延胡索酸(DMF)的基因表达谱。我们发现DMKG和DMF通过诱导NRF2介导的抗氧化信号通路表达,对血红素表现出保护作用。NRF2激活诱导细胞抗铁死亡反应,从而提高SCD EPs的活力和增殖能力。我们的研究结果表明,DMF和DMKG可作为新的SCD治疗选择加以探索。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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