CD8+ T细胞干性先于干预后HIV病毒血症控制

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294440

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

需要诱导持久的HIV缓解的干预措施，以消除终身抗逆转录病毒治疗（ART）的需求。在部分接受广泛中和抗HIV-1抗体（bNAb）给药并进行分析性治疗中断（ATI）的个体中，已实现干预后对病毒血症的持久控制（PIC）1-4。既往研究支持CD8+ T细胞的作用5-9，但参与PIC的CD8+ T细胞的确切特征仍不清楚。在此，我们利用来自四项bNAb接受者ATI试验的纵向样本，对针对自体HIV表位的CD8+ T细胞应答进行了定位和功能分析。PIC与干预前更优的HIV特异性CD8+ T细胞增殖能力、干细胞样记忆表型以及对负载自体HIV肽的CD4+ T细胞的回忆性细胞毒性相关。bNAb给药后，CD8+ T细胞的干性进一步增加，而未出现针对明确HLA最优表位的新克隆型。多模态单细胞分析揭示了与PIC和HIV特异性CD8+ T细胞干性相关的分子特征，包括代谢适应性特征和T细胞耗竭减少。

这些结果确定了先于随后PIC出现的免疫特征，为开发能够诱导持久HIV缓解的联合免疫疗法提供了信息。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。