早期砷暴露对精子质量与附睾转录组的跨代效应：大小RNA整合分析

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE292772

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数据说明

砷（iAs）是一种广泛存在的环境毒物，与生殖功能障碍相关，然而将发育期暴露与精子功能受损及跨代生殖效应联系起来的机制仍不清楚。既往研究主要关注睾丸反应，而iAs对附睾——精子成熟及睾丸后分子重塑的关键部位——的影响却鲜有研究。在本研究中，妊娠C57BL/6J母鼠在整个妊娠期和哺乳期通过饮用水摄入1.15 ppm iAs。对成年雄性子代（F1）及其未暴露的儿子（F2）进行精子质量评估，并采用mRNA测序、小RNA测序、基因集富集分析和加权基因共表达网络分析对附睾组织进行分析。发育期iAs暴露显著降低了F1雄性的精子浓度、精子总数和活力，而未暴露的F2儿子中也观察到精子浓度和精子总数降低。

在F1代附睾中，iAs暴露与线粒体和代谢通路的抑制以及细胞外基质重塑和炎症特征的富集相关。小RNA谱分析显示，线粒体tRNA呈下降趋势，调控性非编码RNA群体发生改变。在F2代附睾中，生殖功能损伤伴随翻译和精子发生相关通路的抑制，以及剪接体小核RNA、小核仁RNA和发育相关microRNA的失调。据我们所知，这是首次对跨代发育性砷暴露后附睾mRNA和小RNA反应进行的整合分析，识别出具有代际特异性的附睾RNA改变，这些改变可能在健康与疾病的发育起源框架内促成与环境相关的生殖功能障碍。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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