野生型小鼠六个月热量限制后皮下白色脂肪组织RNA-seq分析揭示NCOA2剪接改变

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE289240

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数据说明

热量限制（CR）是一种公认的干预措施，可延长多种物种的寿命并延缓年龄相关疾病的发生。尽管既往研究已表明白色脂肪组织（WAT）中存在CR诱导的转录变化，但CR对可变剪接的影响仍研究不足。本研究通过RNA测序（RNA-seq）探究了野生型小鼠在接受为期六个月（从3月龄至9月龄）CR后皮下白色脂肪组织（sWAT）中的基因表达和可变剪接。RNA-seq分析在随意进食（AL）与CR条件之间鉴定出6，058个差异表达基因（DEGs）（p < 0.05；绝对log2倍数变化 >1.0），其中与脂质代谢相关的关键上调基因包括Elovl6、Fasn、Acc和Srebp1c。此外，我们检测到400个显著的可变剪接事件（FDR < 0.05），其中外显子跳跃最为常见。在这些事件中，我们重点关注了代谢相关转录因子Ncoa2，其表现出CR诱导的外显子13包含，使平衡向全长异构体偏移。

功能分析表明，这种转变增强了Ncoa2辅激活因子对参与脂质代谢的核受体的活性。该数据集提供了原始和经过处理的RNA-seq数据，包括基因表达和可变剪接分析，可用于进一步探索CR诱导脂肪组织代谢适应的分子机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。