Williams综合征患者与对照淋巴母细胞系的exon和gene水平转录谱
该数据集来自NCBI GEO,包含Williams综合征患者与父母对照的淋巴母细胞系(LCLs)在exon和gene水平的转录谱数据,使用全基因组外显子水平芯片检测差异表达基因,并通过PCR、RNA-seq和western blot验证

基本信息
资源简介
Williams综合征患者与对照淋巴母细胞系的exon和gene水平转录谱
Exon- and gene-Level transcriptional profiling in Lymphoblastoid Cell Lines (LCLs) from Williams syndrome patients and controls
该数据集来自NCBI GEO,包含Williams综合征患者与父母对照的淋巴母细胞系(LCLs)在exon和gene水平的转录谱数据,使用全基因组外显子水平芯片检测差异表达基因,并通过PCR、RNA-seq和western blot验证。数据覆盖52个个体(34例WS患者、18例父母对照),可用于研究Williams综合征相关的转录网络及其与自闭症谱系障碍和精神分裂症等社交功能障碍疾病的关联(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jan 01 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):Williams综合征(WS)以亲社会性为特征,为研究社交功能障碍背后的转录网络提供了独特模型,与自闭症谱系障碍(ASD)和精神分裂症(SCHZ)等疾病相关。在一个由52个个体(34例WS患者、18例父母对照)建立的淋巴母细胞系队列中,全基因组外显子水平芯片鉴定出一组核心差异表达基因(DEGs),其中WS缺失基因位列最高表达的转录本之中。研究结果通过PCR、RNA-seq和western blot进行了验证。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL5175、9606。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE285666
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 23 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
Williams综合征(WS)以积极社交性为特征,为研究社交功能障碍背后的转录网络提供了独特模型,这与自闭症谱系障碍(ASD)和精神分裂症(SCHZ)等疾病相关。在一个由52名个体(34名WS患者、18名父母对照)建立的淋巴母细胞系队列中,全基因组外显子水平芯片识别出一组核心差异表达基因(DEGs),其中WS缺失基因位居转录本前列。研究结果通过PCR、RNA-seq和western blot得到验证。网络分析揭示了兴奋性树突棘中肌动蛋白细胞骨架信号传导的扰动,以及MAPK、IGF1-PI3K-AKT-mTOR/胰岛素和突触肌动蛋白通路中的相互作用。这些转录网络显示出与ASD和SCHZ的相似性,突出了社交行为障碍中共有的机制。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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