GSE269205：浸润性富脂质巨噬细胞亚群被鉴定为人类良性前列腺增生中前列腺体积增大的调节因子

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE269205

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

巨噬细胞在疾病状态内部及不同疾病状态之间表现出显著的表型异质性。脂质代谢重编程对巨噬细胞活化具有关键调控作用。已在人良性前列腺增生（BPH）组织中观察到慢性炎症，然而巨噬细胞活化状态及其对该增生性疾病的作用尚未明确。我们推测，随着前列腺体积增大，巨噬细胞表型的转变可能涉及代谢改变，进而导致前列腺上皮或间质增生。对来自10例大体积（>90克）和10例小体积（<40克）人前列腺的CD45+移行区白细胞进行了单细胞RNA测序。使用标记基因定义巨噬细胞亚群。BPH巨噬细胞并未明确归类为M1和M2表型。相反，既无极化特征的巨噬细胞在大前列腺与小前列腺相比时发生积聚。具体而言，以TREM2和MARCO表达为标志、脂质代谢通路发生改变的巨噬细胞亚群随着前列腺体积增大而显著积聚。无T细胞亚簇在大前列腺与小前列腺相比时特异性积聚。

TREM2+和MARCO+巨噬细胞的丰度与患者体重指数及前列腺症状评分呈正相关。BPH组织中TREM2+巨噬细胞的中性脂质含量显著高于TREM2-巨噬细胞。富含脂质的巨噬细胞定位于BPH组织的基质区。体外研究表明，与对照巨噬细胞相比，负载脂质的巨噬细胞可促进前列腺上皮细胞和基质细胞的增殖。这些数据定义了新的BPH免疫亚群——TREM2+和MARCO+巨噬细胞，并提示富含脂质的巨噬细胞可能加重大前列腺患者的下尿路症状。仍需进一步研究以评估在BPH中靶向这些细胞的治疗获益。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。