GSE249389：MAP激酶信号转录关闭维持滞育多能性[RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE249389

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

单细胞或多细胞生物暴露于不利环境条件（包括营养缺乏）下，可能诱导一种生命活动暂停或滞育的状态。我们在此报告，通过抑制BET家族含溴结构域蛋白（BET）来广泛抑制RNA Pol II驱动的基因表达，可触发小鼠胚胎干细胞（ES细胞）进入滞育状态。滞育ES细胞上调一组功能相关的基因，这些基因编码MAP激酶信号通路的负调控因子（NRMKS），而该通路在ES细胞分化中起关键作用。NRMKS表达升高是细胞暴露于不同滞育诱导条件（包括mTOR抑制）的标志，并且是滞育期间维持多能性所必需的。在机制上，抑制mTORC1/2导致NRMKS基因启动子处的Capicua转录抑制因子（CIC）迅速减少，随后NRMKS基因转录迅速上调。

支持滞育胚胎干细胞未分化状态的mTOR和BET依赖性转录开关表明，这一机制在不同组织中维持代谢休眠的干细胞或类干细胞未分化状态方面具有更广泛的用途。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。