AK9突变通过改变精子的运动能力损害小鼠和牛的雄性生育力

该数据集来自NCBI GEO,包含一个系列矩阵文件,涉及AK9基因突变对小鼠和牛雄性生育力影响的研究。源站描述指出,一头低受孕率(10%)的亚生育公牛精子运动能力下降、咖啡因诱导的超激活严重减弱,且体外受精或人工授精后的透明带穿透能力、卵裂率、卵裂动力学和囊胚产量均显著低于对照公牛

geo
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基因组分类GPL1702110090
GSE235546: Mutations in AK9 impair male fertility by altering sperm motility in mice and cattle.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

AK9突变通过改变精子的运动能力损害小鼠和牛的雄性生育力

Mutations in AK9 impair male fertility by altering sperm motility in mice and cattle.

该数据集来自NCBI GEO,包含一个系列矩阵文件,涉及AK9基因突变对小鼠和牛雄性生育力影响的研究。源站描述指出,一头低受孕率(10%)的亚生育公牛精子运动能力下降、咖啡因诱导的超激活严重减弱,且体外受精或人工授精后的透明带穿透能力、卵裂率、卵裂动力学和囊胚产量均显著低于对照公牛。全基因组测序和睾丸RNA测序揭示了AK9中影响剪接的关键突变。数据可用于分析相关基因表达谱,支持生育力相关研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 22 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):尽管通过了常规的精液质量实验室检测,用于人工授精(AI)的公牛仍可能表现出显著的生育力差异。在生育力分析中,发现了一头低受孕率(10%)的亚生育公牛。为了全面表征其表型,开展了一系列体外、体内和分子检测。此外,还构建了基因敲除小鼠以研究所鉴定突变基因的功能。与已证实具有生育力的对照公牛相比,该亚生育公牛的精子表现出运动能力下降和咖啡因诱导的超激活严重减弱。体外受精或人工授精后的透明带穿透能力、卵裂率、卵裂动力学和囊胚产量均显著低于对照公牛。全基因组测序和睾丸RNA测序揭示AK9中存在一个影响剪接的关键突变,塑造了主要的

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL17021、10090。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE235546

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 22 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管公牛在常规精液质量实验室检测中均合格,但用于人工授精(AI)的公牛在生育力上仍可能表现出显著差异。在生育力分析中,发现一头低生育力公牛,其妊娠率仅为10%。为全面表征该表型,开展了一系列体外、体内及分子学检测。此外,还构建了基因敲除小鼠以研究所鉴定突变基因的功能。与已证实具有生育力的对照公牛相比,该低生育力公牛的精子活力降低,且咖啡因诱导的超活化严重减弱。在体外受精(IVF)或人工授精后,其穿透透明带的能力、卵裂率、卵裂动力学及囊胚产量均显著低于对照公牛。睾丸全基因组测序和RNA测序揭示AK9存在一个影响剪接的关键突变,该突变改变了大多数AK9转录本,导致提前终止密码子和严重截短的蛋白质。构建了AK9缺陷的转基因小鼠,其产生的精子无活力,无法使卵母细胞受精。

这些精子表现出异常,包括ATP浓度低。睾丸的RNA-seq分析揭示了轴丝和精子鞭毛组分以及类固醇代谢过程的基因表达差异。精子超微结构分析显示,鞭毛异常的精子比例较高。AK9突变公牛和AK9缺陷小鼠产生的不育表明,AK9在精子活力和/或超激活中具有重要的代谢作用,进而影响精子结合和穿透透明带。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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