油酸暴露的静息CD4+ T细胞免疫代谢相关基因上调及活化后IL-9+频率增加的DNA甲基化数据集

该数据集来自NCBI GEO,聚焦油酸对静息CD4+ T细胞的影响。源站描述显示,研究对9名供者的静息CD4+ T细胞在30µg/mL油酸暴露0.5、3、24、48和72小时后进行RNA测序,发现胆固醇生物合成基因(HMGCR、SQLE、MVD、MVK)和从头脂肪酸生物合成基因(ACACA、FASN

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基因组GPL211459606
GSE231457: Resting CD4+ T cells exposed to oleic acid upregulate genes involved in immunometabolism resulting in increased IL-9+ frequencies post-activation [DNA methylation]

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

油酸暴露的静息CD4+ T细胞免疫代谢相关基因上调及活化后IL-9+频率增加的DNA甲基化数据集

Resting CD4+ T cells exposed to oleic acid upregulate genes involved in immunometabolism resulting in increased IL-9+ frequencies post-activation [DNA methylation]

该数据集来自NCBI GEO,聚焦油酸对静息CD4+ T细胞的影响。源站描述显示,研究对9名供者的静息CD4+ T细胞在30µg/mL油酸暴露0.5、3、24、48和72小时后进行RNA测序,发现胆固醇生物合成基因(HMGCR、SQLE、MVD、MVK)和从头脂肪酸生物合成基因(ACACA、FASN)上调,提示细胞向促炎状态代谢重编程;随后用26标志物光谱流式细胞术面板显示活化后IL-9+频率增加。本数据集为DNA甲基化数据,文件为GSE231457_series_matrix.txt.gz,可用于研究油酸暴露下CD4+ T细胞的表观遗传变化及其与免疫代谢和T细胞极化之间的关系(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 02 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):T细胞是动脉粥样硬化斑块中最常见的免疫细胞。此外,T细胞功能受到循环和动脉粥样硬化斑块中丰富的脂肪酸的影响。在这里,我们定义了油酸(人体循环中最丰富的脂肪酸之一)对静息CD4+ T细胞转录组的影响,以及随后活化后细胞向T细胞亚群极化的影响。我们首先对来自9名供者的静息CD4+ T细胞在30µg/mL油酸暴露0.5、3、24、48和72小时后进行了RNA测序。这揭示了参与胆固醇生物合成(HMGCR、SQLE、MVD和MVK)和从头脂肪酸生物合成(ACACA和FASN)的基因上调。这两条通路均指向细胞向促炎状态的代谢重编程。随后,一个26标志物光谱流式细胞术面板显示频率增加

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL21145、9606。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE231457

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 14 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

T细胞是动脉粥样硬化斑块中最常见的免疫细胞。此外,T细胞功能受循环和动脉粥样硬化斑块中丰富的脂肪酸影响。在本研究中,我们明确了油酸(人体循环中最丰富的脂肪酸之一)对静息CD4+ T细胞转录组的影响,以及随后对细胞活化后向T细胞亚群极化的影响。我们首先对来自9名供体的静息CD4+ T细胞在暴露于30µg/mL油酸0.5、3、24、48和72小时后进行了RNA测序。结果显示,参与胆固醇生物合成的基因(HMGCR、SQLE、MVD和MVK)以及脂肪酸从头生物合成的基因(ACACA和FASN)表达上调。这两条通路均提示细胞向促炎状态发生代谢重编程。随后,采用26标志物光谱流式细胞术面板检测显示,预先暴露于油酸的活化CD4+ T细胞中IL-9+和IL-17A+细胞频率增加。IL-9和IL-17A主要由相应的辅助性T(TH)亚群TH9和TH17产生,其中尤其是TH9与动脉粥样硬化的加重有关。

我们的数据表明,油酸可能诱导静息CD4+ T细胞的免疫代谢向活化型转变,从而导致这些细胞在活化后向更促炎和促动脉粥样硬化的极化方向分化。综上所述,我们的研究提示循环脂肪酸与CD4+ T细胞之间的相互作用在动脉粥样硬化的发生和发病机制中可能发挥作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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