烟曲霉HapX介导的铁饥饿适应对毒力的必需性

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE22052

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数据说明

铁是众多细胞过程中的必需辅因子。既往研究表明，铁载体介导的铁摄取及细胞内铁处理对烟曲霉的毒力至关重要。本研究发现，bZIP型转录因子HapX在该机会性真菌病原体适应铁饥饿所需的转录重塑中发挥关键作用。研究发现HapX与先前鉴定的铁调控因子SreA以负反馈环路相互关联：在铁充足条件下SreA抑制hapX表达，而在铁饥饿条件下HapX抑制sreA。全基因组转录谱分析及特定代谢物（原卟啉IX、铁载体和氨基酸）分析表明，铁饥饿引发广泛的代谢重塑。研究发现HapX同时参与铁饥饿期间基因的抑制与激活。HapX尤其为抑制铁依赖性及线粒体定位的活性所必需，包括呼吸、TCA循环、氨基酸代谢、铁硫簇生物合成及血红素生物合成。

受HapX正向调控的通路包括铁载体的产生以及核糖毒素和主要过敏原AspF1的生成。对游离氨基酸池的分析显示，HapX依赖性地协调了铁载体的产生与其前体鸟氨酸的供应。与hapX表达模式一致，在铁缺乏条件下，HapX缺陷对生长速率和分生孢子形成有害，而在铁充足条件下则不然。HapX缺陷在小鼠曲霉病模型中导致毒力显著减弱，这强调烟曲霉在宿主体内面临铁饥饿，因此HapX依赖性的代谢重编程对毒力至关重要。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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