人内皮细胞中SIRT6依赖的基因转录谱

该数据集来自NCBI GEO,包含人脐静脉内皮细胞(HUVEC)在对照腺病毒与SIRT6腺病毒感染后的RNA-seq表达谱,用于研究SIRT6对 endothelial 基因转录组的影响

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基因组分类GPL203019606
GSE213425: SIRT6-dependent gene transcriptional profile in human endothelial cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

人内皮细胞中SIRT6依赖的基因转录谱

SIRT6-dependent gene transcriptional profile in human endothelial cells

该数据集来自NCBI GEO,包含人脐静脉内皮细胞(HUVEC)在对照腺病毒与SIRT6腺病毒感染后的RNA-seq表达谱,用于研究SIRT6对 endothelial 基因转录组的影响。数据覆盖SIRT6依赖的差异表达基因及GO、通路富集和功能注释聚类分析结果,可用于探索SIRT6在内皮功能障碍和动脉粥样硬化中的转录调控机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 15 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Sirtuin 6(SIRT6)是一种公认的长寿基因,调控基因组稳定、DNA修复、炎症和代谢稳态。在载脂蛋白E缺陷小鼠和人类患者的动脉粥样硬化病变中,SIRT6表达降低。在内皮细胞(ECs)中,长期暴露于脂多糖、过氧化氢和高糖刺激下,SIRT6表达也降低,这三者是与内皮功能障碍和动脉粥样硬化形成相关的危险因素。为了解SIRT6对内皮基因转录组影响的机制,我们对感染对照腺病毒和SIRT6腺病毒的人脐静脉内皮细胞(HUVECs)进行了RNA测序(RNA-seq)分析。进行了基因本体(GO)、通路富集和功能注释聚类分析,以对差异表达基因进行分类并鉴定最si

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL20301、9606。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE213425

【使用注意】

· 源站最后修改于 Nov 24 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Sirtuin 6(SIRT6)是一个公认的长寿基因,调控基因组稳定性、DNA修复、炎症和代谢稳态。在载脂蛋白E缺陷小鼠和人类患者的动脉粥样硬化病变中,SIRT6表达降低。在内皮细胞(ECs)中,长期暴露于脂多糖、过氧化氢和高糖刺激下,SIRT6表达同样降低,这三者均为与内皮功能障碍和动脉粥样硬化形成相关的风险因素。为了从机制上探究SIRT6对内皮基因转录组的影响,我们对感染对照腺病毒和SIRT6腺病毒的人脐静脉内皮细胞(HUVECs)进行了RNA测序(RNA-seq)分析。通过基因本体论(GO)、通路富集和功能注释聚类分析,对差异表达基因进行分类,并鉴定出最显著富集的GO术语/通路/基因簇。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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