转录调控因子AflR对黄曲霉整体调控机制的研究

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE179978

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数据说明

目的：黄曲霉aflR基因编码一个Zn(II)2Cys6 DNA结合结构域，是黄曲霉毒素生物合成基因簇的重要转录调控因子。我们前期对黄曲霉中AflR结合位点的GO分析结果提示，AflR可能发挥整合调控作用。本研究旨在探究aflR基因在黄曲霉中的整合功能。设计：本研究以黄曲霉NRRL3357为野生型菌株(WT)，通过同源重组构建了黄曲霉ΔaflR敲除菌株。基于转录组学技术，我们研究了aflR基因对黄曲霉生长、发育和毒素合成的代谢效应，并在转录水平上探讨了aflR基因对黄曲霉的整体调控机制。结果：aflR的破坏严重影响了黄曲霉毒素生物合成途径，导致黄曲霉毒素产量显著下降。此外，aflR基因破坏菌株产生的分生孢子相对稀疏，菌核数量极少。然而，环匹阿尼酸(CPA)的生物合成未受aflR基因破坏的影响。

对在PDA平板上培养0小时、24小时和72小时的ΔaflR菌株进行转录组分析显示，参与黄曲霉毒素生物合成的聚类基因表达显著下调。同时，与WT菌株相比，ΔaflR菌株在孢子萌发、菌核发育和碳水化合物代谢相关基因上表现出显著的表达差异。结论：结果表明，黄曲霉的aflR基因在真菌生长发育中也发挥着积极作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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