类风湿关节炎滑膜微环境诱导树突状细胞代谢与功能适应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE151897

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数据说明

类风湿关节炎（RA）是一种慢性自身免疫性疾病，可导致软骨和骨骼的破坏。众所周知，RA的病理标志是炎症细胞大量涌入关节。然而，树突状细胞（DC）在这一炎症环境中可能发挥的作用仍相对未被充分探索。此外，这种独特的滑膜微环境对DC功能和成熟的影响仍不清楚。利用单核细胞衍生的DC（MoDC），我们建立了一种体外模型来模拟滑膜微环境，以探究DC的成熟过程。用来自离体滑膜组织活检培养物的条件培养基（ECM）处理的MoDC，其促炎细胞因子、趋化因子和黏附分子的表达增加。经ECM处理的DC中CD83和CCR7表达增加，CCR5表达和吞噬能力下降，提示DC成熟增强。ECM诱导的成熟伴随着细胞生物能量学的改变，即在ECM处理的DC中观察到糖酵解基因表达增加和葡萄糖摄取增加。总体而言，这导致DC代谢向糖酵解方向转变。

这些适应性变化部分通过STAT3介导，表现为在ECM处理的DC中，STAT3抑制后促炎细胞因子和糖酵解基因表达降低。最后，为了将这些数据转化到更贴近体内临床相关的情境中，我们分析了一个先前发表的滑膜DC数据集，发现与循环中的DC相比，滑膜DC中糖酵解基因表达增强。综上所述，我们的数据表明，RA中的滑膜微环境促进了DC的成熟和代谢重编程。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。