健康供者非动员外周血人造血干细胞亚群转录组

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE131409

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

将索引分选与单细胞功能检测相结合，从健康个体外周血（PB）中鉴定出两个功能不同的表型造血干细胞和多能祖细胞（HSC/MPP）亚群。来自PB的CD71- HSC/MPP具有多能性，能够重建NSG异种移植模型。CD71+ HSC/MPP是表型HSC/MPP的一个亚群，其独特地局限于产生红系和巨核系谱系，并在血小板生成慢性刺激的条件下（例如频繁捐献血小板、特发性血小板减少性紫癜、原发性血小板增多症）扩增。在此，我们报告了来自CD71- HSC/MPP（CD19- CD38- CD45RA- CD34lo CD71-）和CD71+ HSC/MPP（CD19- CD38- CD45RA- CD34lo CD71+）的20个细胞池的批量转录组。总体而言，数据显示了两个亚群之间的转录相似性和差异。研究表明，CD71+ HSC/MPP独特的红系/巨核系谱系 priming 已在转录水平上启动，并且CD71+ HSC/MPP在蛋白质合成/代谢途径方面与CD71- HSC/MPP不同。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。