IGF1介导的人胚胎干细胞自我更新重现胚胎微环境

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE126488

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管人类多能上胚层细胞具有基础生物学和临床重要性，但我们对调控这些细胞的信号通路的理解仍然有限。在本研究中，我们挖掘了人类胚胎转录组数据集，鉴定出胰岛素和胰岛素样生长因子1（IGF1）受体以及IGF1配体的转录本表达。在补充了IGF1的培养基中培养的人类胚胎，表达NANOG的多能上胚层祖细胞比例增加。因此，我们基于人类胚胎的信号环境，构建了一种最低限度的化学成分明确培养基。我们在这些条件下建立了多株人类胚胎干细胞（hESC）系，并将成纤维细胞重编程为诱导多能干细胞（iPSC）。转录组和蛋白质表达分析证实，这些hESC和iPSC表达多能性相关基因。此外，hESC和iPSC保持了高存活率、自发分化和定向分化的能力以及正常的核型。

相比之下，成纤维细胞生长因子2（FGF2）对外胚层发育有害，而对于在外源性胰岛素或IGF1中维持的hESC培养则是可有可无的。这是整合人类囊胚信号传导见解用于定义更贴近胚胎微环境的hESC培养条件的首个实例。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。