基本信息

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创建/更新时间

2026-10-06

资源简介

E-PROT-44：人类松果体蛋白质组特征描述

E-PROT-44: Characterization of human pineal gland proteome 是一个以人类松果体蛋白质组特征描述为主题的公开数据集，收录于 EBI（欧洲生物信息学研究所）的 Expression Atlas 平台，属于基线（Baseline）类型的实验数据。该数据集的物种为 Homo sapiens，在本站被归类于内分泌系统疾病 / 其他类别之下。从整体定位来看，它面向的是对人类松果体这一内分泌器官在蛋白质层面表达情况的基础性刻画，而非针对某一特定疾病状态或干预条件的比较研究。作为 Expression Atlas 中的一项基线实验，它的核心价值在于为研究者提供一个关于人类松果体蛋白质组成的基础参照，帮助理解该组织在正常生理条件下的分子构成特征。数据集名称中的“E-PROT-44”为其在来源平台中的标识编号，便于在相关数据库中进行检索与引用。

【数据集背景】

人类松果体是一个位于脑内的小型内分泌器官，在生物节律调节和褪黑素合成等方面具有重要生理功能。围绕该器官的分子层面研究，尤其是蛋白质组的系统刻画，有助于建立对其组成成分的整体认识。该数据集正是在这一背景下产生，属于 Expression Atlas 中的基线实验类型，主题标签为 Baseline，说明其关注的是基础状态下的表达特征，而非疾病、处理或时间序列等条件下的差异表达。来源站为 ebi.ac.uk，表明该数据由 EBI 的 Expression Atlas 平台对外发布和维护。

【数据内容】

根据来源站的描述，该实验的内容为“Characterization of human pineal gland proteome”，即对人类松果体蛋白质组的特征描述。物种为 Homo sapiens。数据集在本站被归入内分泌系统疾病 / 其他分类，主题标签为 Baseline。除上述信息外，关于具体检测了哪些蛋白质、覆盖多少基因或蛋白、样本数量、定量数值等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk，具体为 EBI 的 Expression Atlas 实验记录，属于 Baseline 类型。其英文名称为 E-PROT-44: Characterization of human pineal gland proteome。关于样本采集地点、采集时间、供体信息、实验操作流程等具体采集细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于需要了解人类松果体蛋白质组基础特征的研究场景，例如作为正常松果体组织的蛋白质表达参照，或用于与其他条件下松果体分子数据的对照比较。由于其主题标签为 Baseline，它更适合用于基础性、背景性的分析，而非直接用于疾病机制推断。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供进一步说明。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas 平台进行访问与检索，标识为 E-PROT-44。使用者可依据该标识在平台中定位相应实验记录。关于数据下载格式、分析工具、接口调用方式等具体使用途径，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 Expression Atlas 中的基线实验，物种明确为 Homo sapiens，主题为人类松果体蛋白质组特征描述。关于数据质量评估指标、样本量、覆盖度、技术平台、批次效应等质量相关信息，以及该数据集在适用范围上的具体限制，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk，属于 EBI Expression Atlas 平台发布的内容。关于具体的引用格式、文献出处、许可协议类型及使用条款，源站未提供。

原始链接

https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-PROT-44

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-PROT-44

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Baseline). Species: Homo sapiens. Characterization of human pineal gland proteome

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别