DNA甲基化与逆境：My Body My Story (MBMS) 表观遗传分析数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.7910/dvn/aebren

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 3.1 MB。

数据说明

DNA甲基化与逆境研究（<a href=“https://reporter.nih.gov/search/-EjBRKSbNka35E805Qlx-Q/project-details/10363700”>NIH R01MD014304</a>；项目期：2019年9月1日至2026年3月31日）旨在探究DNA甲基化（DNAm）如何随种族歧视、经济困难和空气污染暴露而变化，以及这些表观遗传改变如何可能导致心脏代谢疾病风险和加速衰老（表观遗传年龄>实际年龄）方面的不平等。<br/><br/>本数据集记录存档了用于R01MD014304分析所需的My Body My Story（MBMS）表观遗传分析数据集。MBMS（<a href=“https://reporter.nih.gov/search/hYlqkozpVECbK0ngAkbbYQ/project-details/7877776”>NIH R01AG027122</a>；项目期：2007年9月15日至2013年6月30日）是一项关于种族歧视与心脏代谢健康的横断面、基于人群的研究，从马萨诸塞州波士顿的四家社区健康中心随机招募了1，005名美国出生的非西班牙裔黑人（n = 504）和非西班牙裔白人（n = 501）成年人，年龄35至64岁（2008年至2010年）。

MBMS包含了对生命历程中种族歧视和社会经济地位的详细测量、居住地空气污染、心血管代谢结局以及相关协变量。<br/><br/>对于R01MD014304项目，储存的MBMS干血斑在2020–2021年间使用Illumina MethylationEPIC BeadChip进行了检测，生成了293名参与者的全基因组DNAm数据。此处描述的去标识化表观遗传分析数据集包括DNAm测量指标（含多种表观遗传时钟及其他基于DNAm的指数），并与该项目主要分析所需的MBMS社会、临床和情境变量相关联。<br/><br/>为便于比较，R01MD014304项目还使用了来自Multi‑Ethnic Study of Atherosclerosis（MESA）的类似数据以及公开可用的美国人口普查和环境数据。这些外部数据集未包含在此处记录的MBMS表观遗传分析数据集中；研究者必须直接获取它们。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。