血浆血清素与牛磺酸降低是年龄相关性黄斑变性的代谢特征

该数据集包含来自年龄相关性黄斑变性(AMD)患者与对照参与者的代谢组学数据,涵盖处理后的代谢组学测量值、临床数据、遗传风险评分(GRS)以及52个与AMD相关单核苷酸多态性(SNP)的等位基因评分

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基因组分类Medicine, Health and Life SciencesAge-related macular degenerationtargeted plasma metabolomicsGRS-52serotonintaurine
Diminished plasma serotonin and taurine levels are a metabolic feature of age-related macular degeneration

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

血浆血清素与牛磺酸降低是年龄相关性黄斑变性的代谢特征

Diminished plasma serotonin and taurine levels are a metabolic feature of age-related macular degeneration

该数据集包含来自年龄相关性黄斑变性(AMD)患者与对照参与者的代谢组学数据,涵盖处理后的代谢组学测量值、临床数据、遗传风险评分(GRS)以及52个与AMD相关单核苷酸多态性(SNP)的等位基因评分。数据集共99个样本,分为对照组(noAMD)39例、早期/中期AMD(eAMD)21例、晚期AMD(lAMD)39例;另有1例AMD样本和1例对照样本因采样后诊断出不符合纳入标准的不相关疾病而被排除在分析之外,但仍保留在数据集中。该数据可用于探索AMD相关的代谢特征与遗传风险关联(来源 DOI 解析)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含从年龄相关性黄斑变性(AMD)患者和对照参与者采集的样本的代谢组学数据。数据包括每个样本的处理后代谢组学测量值、临床数据和遗传风险评分(GRS),以及与AMD相关的52个单核苷酸多态性(SNP)的等位基因评分。数据信息:该数据集包含99个样本,组织如下:对照组(noAMD):39个样本;早期/中期AMD(eAMD):21个样本;晚期AMD(lAMD):39个样本。一个AMD样本(I-AMD 041)和一个对照样本(I-AMD HC 021)被排除在分析之外。这些样本仍保留在数据集中,但由于采样后诊断出不符合研究纳入标准的不相关疾病,未纳入分析。数据限制:由于医院数据保护政策和p

【主题与分类】

主题标签:Medicine, Health and Life Sciences、Age-related macular degeneration、targeted plasma metabolomics、GRS-52、serotonin、taurine。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://dataverse.nl/citation?persistentId=doi:10.34894/J9MZRO

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自年龄相关性黄斑变性(AMD)患者和对照参与者样本的代谢组学数据。数据包括每个样本的处理后代谢组学测量值、临床数据和遗传风险评分(GRS),以及与AMD相关的52个单核苷酸多态性(SNPs)的等位基因评分。数据信息:该数据集包含99个样本,组织如下:对照组(noAMD):39个样本;早期/中期AMD(eAMD):21个样本;晚期AMD(lAMD):39个样本。一个AMD样本(I-AMD 041)和一个对照样本(I-AMD HC 021)被排除在分析之外。这些样本仍保留在数据集中,但由于采样后诊断出不符合研究纳入标准的无关疾病状况,未纳入分析。数据限制:由于医院数据保护政策和隐私法规,本研究的基础数据和元数据在限制条件下提供。研究人员可通过PI和数据管理员申请访问权限。请填写申请表或通过联系所有者按钮(本页右上角)进行联系。

关于已上传数据集文件的信息:所有数据文件的完整概述在README中有描述。转到Files选项卡,点击“Change view to Tree”以查看文件夹结构。该数据集由以下主要部分组成:paper_analysis.Rmd,用于执行统计分析并生成论文的图表(另见paper_analysis.html)。此RMD文件依赖于R文件夹中00_functions.R定义的函数。Data文件夹,包含原始数据和处理后的数据文件,以及元数据文件。Output文件夹,存储分析结果,包括图表和缓存的数据文件。R文件夹,包含用于数据处理和分析的R脚本。External Files文件夹,包含任何额外的外部资源,如图形mad

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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