TAPBPR 将 UGT1 桥接到 MHC I 类分子以提供抗原呈递通路质量控制的数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.8fh3g

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 151.0 KB。

数据说明

最近我们发现，TAPBPR是一种肽交换催化剂，对于MHC I类分子实现最佳肽选择至关重要。在此，我们探究是否还有其他辅因子与TAPBPR相关联，从而解释其对肽选择的影响。我们发现了TAPBPR与UDP-葡萄糖：糖蛋白葡萄糖基转移酶1（UGT1）之间的相互作用，UGT1是钙联蛋白/钙网蛋白质量控制循环中的折叠感应器，已知能再生糖蛋白上的Glc1Man9GlcNAc2部分。我们的结果表明，形成了一个多聚体复合物，该复合物依赖于TAPBPR第94位保守的半胱氨酸，其中TAPBPR促进了UGT1与肽受体型I类分子的结合。我们揭示了TAPBPR与UGT1之间的相互作用促进了I类分子上聚糖的再葡萄糖基化，进而促进其被钙网蛋白识别。我们的结果表明，TAPBPR除了作为肽编辑器外，还通过促进肽受体型MHC I类分子与肽加载复合物的结合，来提高肽的优化。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。