年龄相关的人CD4+ T淋巴细胞基础NF-κB功能变化与PI3K失调（数据集2）

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-62332

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

免疫损伤和高循环水平的促炎细胞因子是人类衰老的标志。然而，免疫失调的分子基础及炎症标志物的来源尚不清楚。在此，我们证明，在没有明显细胞刺激的情况下，来自老年人的纯化并静息的人CD4+ T淋巴细胞中，由转录因子NF-κB介导的基因表达高于年轻人。这种NF-κB相关转录的增加包括促炎细胞因子如IL-1和趋化因子如CCL2和CXCL10的转录本。我们证明，NF-κB上调是细胞内在的，部分由代谢活动诱导的磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)活性介导，而雷帕霉素治疗可以缓和这一过程。我们的观察提供了直接证据，表明失调的基础NF-κB活性可能促进衰老过程中的轻度促炎状态。使用Ficoll-Paque Plus密度梯度离心法从肝素化血液中分离出外周血单核细胞(PBMCs)。通过使用抗人CD4微珠进行阳性选择获得CD4+ T细胞。

在37°C（5% CO2培养箱）中孵育4小时后，收集细胞并通过离心沉淀。使用Qiagen RNeasy方案制备总细胞RNA。标记和扩增按照Illumina标准方案进行，生物素标记的cRNA与Illumina的HumanHT-12 v4 Expression BeadChip杂交。清洗、封闭芯片后，通过链霉亲和素-Cy3染色检测生物素标记的cRNA。样本分为两个年龄组，年轻组和老年组，以65岁及以上作为老年组的界限。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。