WTCCC 1型糖尿病病例对照研究 - 合并对照组

该数据集来自 omicsdi.org,为 WTCCC 针对 1型糖尿病(T1D)开展的全基因组病例对照关联研究,采用六个疾病收集样本,并以 1958 British Birth Cohort 与 UK National Blood Service 收集样本作为对照

omicsdi
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时间序列分类Genomics
WTCCC case-control study for Type 1 Diabetes - Combined Controls

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

WTCCC 1型糖尿病病例对照研究 - 合并对照组

WTCCC case-control study for Type 1 Diabetes - Combined Controls 是一个面向1型糖尿病遗传关联研究的公开数据集,收录于 omicsdi.org,并在本站归入内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病分类。该数据集的核心内容是 WTCCC 针对1型糖尿病(T1D)开展的全基因组病例对照关联研究,研究设计采用六个疾病收集样本,同时以 1958 British Birth Cohort 与 UK National Blood Service 收集样本作为对照,主题标签为 Genomics。整体来看,该数据集服务于全基因组关联分析场景,围绕1型糖尿病的病例与对照样本组织数据,可用于探索遗传变异与1型糖尿病之间的关联信号,是糖尿病遗传学研究中具有明确病例对照结构的资源。

【数据集背景】

该数据集来自 omicsdi.org,属于 WTCCC 针对1型糖尿病开展的全基因组病例对照关联研究。1型糖尿病是一种与遗传易感性密切相关的疾病,全基因组病例对照关联研究是识别疾病相关遗传变异的常用策略。WTCCC 的这一研究以1型糖尿病为研究对象,通过设置病例组与对照组,试图在全基因组范围内考察遗传变异与疾病状态之间的统计关联。该数据集在本站被归入内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病分类,主题标签为 Genomics,说明其内容聚焦于基因组层面的糖尿病研究数据。

【数据内容】

该数据集为 WTCCC 针对1型糖尿病的全基因组病例对照关联研究数据,采用六个疾病收集样本,并以 1958 British Birth Cohort 与 UK National Blood Service 收集样本作为对照。其英文名称为 WTCCC case-control study for Type 1 Diabetes - Combined Controls,表明该数据集在对照设置上具有“Combined Controls”的特征,即将不同来源的对照样本合并使用。除上述信息外,源站未提供关于样本量、变异位点数量、数据文件格式、字段结构等更细粒度的说明。

【采集与来源】

该数据集来源站为 omicsdi.org。研究样本方面,病例侧来自六个疾病收集样本,对照侧来自 1958 British Birth Cohort 与 UK National Blood Service 收集样本。上述信息表明其采集与来源具有多来源组合的特点,病例与对照分别来自不同的收集渠道。关于各收集渠道的具体招募方式、采集时间、地理范围、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于全基因组病例对照关联研究相关场景,尤其是围绕1型糖尿病的遗传关联分析。研究人员可将其用于考察遗传变异与1型糖尿病之间的关联,也可在方法学层面用于病例对照设计的分析流程验证。由于主题标签为 Genomics,其典型使用场景属于基因组学与糖尿病遗传研究交叉领域。关于是否适用于其他疾病、其他人群或特定分析软件,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为 WTCCC 针对1型糖尿病的全基因组病例对照关联研究数据,使用时应围绕病例与对照的分组结构展开分析。病例组对应六个疾病收集样本,对照组对应 1958 British Birth Cohort 与 UK National Blood Service 收集样本。关于具体的数据下载方式、文件组织、分析流程、质控步骤和统计模型,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集采用六个疾病收集样本作为病例,并以 1958 British Birth Cohort 与 UK National Blood Service 收集样本作为对照,属于多来源样本组合的病例对照设计。关于样本量、基因分型平台、质控指标、群体分层校正情况、数据完整性及已知偏差,源站未提供。因此,在缺乏这些信息的情况下,无法对该数据集的质量水平作出进一步判断。

【引用与许可】

该数据集来源站为 omicsdi.org。关于引用方式、许可协议、使用条款及数据再分发规定,源站未提供。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00000000015

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

WTCCC全基因组病例对照关联研究,针对1型糖尿病(T1D),使用了六个疾病收集组,以及1958年英国出生队列和英国国家血液服务收集组作为对照组。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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